舒尔哈齐不甘心变成一个有名无实的二老爷，于是，他与长子阿尔通阿、三子扎萨克图商议“吾岂以衣食受羁于人哉”(《清史稿·舒尔哈齐传》)，图谋另立门户，与努尔哈赤分庭抗礼。这就有了舒尔哈齐率诸子和亲信部众移居临近明朝军事重镇铁岭的黑扯木，开辟根据地。李成梁看到这一分化女真的大好机会，立即上奏朝廷册封舒尔哈齐为建州右卫首领。这是明朝在辽东地区设立的最高地方军事长官。
努尔哈赤责令舒尔哈齐放弃自立为王，劝说无效，于是采取强硬措施，于万历三十七年诛杀舒尔哈齐二子阿尔通阿、扎萨克图，将舒尔哈齐下狱。
《满洲秘档·太祖责弟》记载：“上怒，籍收舒尔哈齐家产，杀族子阿萨布，焚杀蒙古大臣乌勒昆，使舒尔哈齐离群索居，俾知愧悔，舒尔哈齐果愧悔来归，上以所籍收之产返之。然舒尔哈齐仍怀缺望，越二年，辛亥八月十九日，遂抑郁而卒。”
努尔哈赤没有杀舒尔哈齐，也没有放舒尔哈齐。万历三十九年八月十九日，舒尔哈齐在囚禁中死去，时年48岁。
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舒尔哈齐死了，但努尔哈赤和皇太极、多尔衮都不情愿为他做一些追封的表示，直至顺治十年福临亲政后才给他这位开国大元勋一顶和硕庄亲王的帽子，此时距舒尔哈齐死时已有42年之久。这个追封，应该与其子济尔哈朗参与清洗多尔衮势力，有大功于顺治帝而得。舒尔哈齐的和硕庄亲王爵位，并未让其子继承。
清初撰《开国诸王公诸大臣传》、乾隆年撰《宗室王公功绩表传》，始终未给舒尔哈齐立传。而对《清太祖实录》中没有记载的太祖兄弟、通达郡王雅尔哈齐和太祖叔叔、武功郡王礼敦、慧哲郡王额尔衮、宣献郡王斋堪，反而被补充立传。
《太祖秘史》中的舒尔哈齐被侄儿褚英弄死
清朝官方文书对舒尔哈齐的记载多为丑化、贬抑，《满文老档》记载：“聪睿恭敬汗之弟舒尔哈齐贝勒，因系同父同母所生之弟，虽无才能，因系汗之唯一亲弟，诸凡物品皆同样给与养之。”这与史实形成了巨大反差，直至民国初修《清史稿》才给了他一个列传，但只说乌碣岩一战和移居黑扯木二事。
舒尔哈齐的死，死于自己对权势的欲望与野心，也死于努尔哈赤对功臣的猜忌与无情。
虽然金梁称舒尔哈齐被幽禁时“抑郁而卒”，但在不少明朝文人看来，是被努尔哈赤杀死的。沈国元《皇明从信录》云：“奴儿哈赤杀其弟速儿哈赤，并其兵。”茅瑞征《东夷考略》称：“奴酋忌其弟速儿哈赤兵强，计杀之。”张鼐《辽夷略》记载：“奴儿哈赤杀其弟速儿哈赤，复耀兵侵乌喇诸酋。”
小编觉得舒尔哈齐的死难免与努尔哈赤脱不了干系。关于舒尔哈齐的死就说到这里咯。
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