关于肯尼迪被刺杀的原因有很多说法，但是目前并没有确切的答案，我为大家整理了各种角度的看法，以供参考。
中情局论：强大的美国中央情报局(CIA)在几乎所有阴谋论中都会被提到，特工处、联邦调查局(FBI)和五角大楼亦如此。阴谋论者认为，中情局想报复肯尼迪攻打古巴猪湾失败，也可能中情局害怕被五角大楼夺走权力。
美联储论：在遇刺的几个月前，肯尼迪签署了一份行政命令，授权财政部发行银元券。阴谋论者认为，美国的央行美联储由一个国际银行家秘密组织控制，他们担心此举会导致美联储的控制权落到财政部长手里。
古巴论：鉴于古巴和美国之间关系紧张，有人怀疑，要么是古巴革命领袖菲德尔·卡斯特罗意欲报复对猪湾的失败入侵，要么是反卡斯特罗的古巴流亡者对肯尼迪听任攻打猪湾行动失败感到愤怒。
黑手党论：FBI在肯尼迪之弟、司法部长罗伯特·肯尼迪的领导下打击有组织犯罪活动，据说各主要黑手党头目大为恼火。根据这个推测，黑手党派杰克·鲁比杀死了奥斯瓦尔德，以防他们的阴谋曝光。
约翰逊论：按照这个推测，肯尼迪的副总统林登约翰逊想除掉总统取而代之。还有人猜测约翰逊想隐瞒一起腐败丑闻，或者是工业大亨出钱让他杀死肯尼迪，因为他们觉得约翰逊比肯尼迪更能代表他们的利益。
草丘论：可疑的阴影、嫌疑枪手的轮廓、照片和录像上的白烟等致使多年来一直有人怀疑除了李·哈维·奥斯瓦尔德以外还有另外一个枪手。据说有录音资料证明，除了奥斯瓦尔德打出的三枪以外，还有笫四声枪响。笫四枪应当是从上面射出的，地点是肯尼迪遇刺时所经街道旁的一个小土包。
不明飞行物论：没有飞碟的阴谋论清单是不完整的。UFO论者声称，肯尼迪遇刺是因为―外星人太感兴趣并扬言要公开中情局的秘密计划。作为“证据”，他们拿出了据说是肯尼迪在遇刺十天前写给中情局的一封信，信中要求查阅关于UFO的秘密文件。据说中情局局长回信称，他那些机密文件交给总统。
克格勃论：当时的冷战紧张气氛促使一些人认为俄罗斯的秘密机构克格勃下令杀死了肯尼迪。枪手奥斯瓦尔德在苏联待过两年，妻子是俄罗斯人，他本人与苏联外交官有来往。至今仍有人推测，克格勃招募了奥斯瓦尔德为其效力，并由他杀死了肯尼迪。
同性恋论：这个推测认为，肯尼迪是被一个心怀嫉妒的同性恋男子杀死的。前新奥尔良地区检察官吉姆·加里森宣称，飞行员戴维·费列是暗杀肯尼迪的主谋。肯尼迪拥有费列所没有的一切：事业有成、英俊潇洒、受人欢迎、家境富裕、有男子气概。加里森认定谋划刺杀肯尼迪的是一帮同性恋男子，他们纯粹只是想让总统去死并从中取乐。
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