1999年8月至2000年12月，俄政府和军队为彻底消灭车臣非法武装，发起第二次车臣战争。此次战争是俄联邦武装力量与其他强力部门联合进行的一场大规模反恐怖特种作战。俄政府和军队充分吸取了第一次车臣战争失败的教训，精心准备、缜密筹划，歼灭了大部分车臣非法武装分子，总体上控制了车臣地区，初步达成预定战争目的。
行动坚决，上下同欲。1994年第一次车臣战争时，俄政界对出兵车臣存在严重分歧，俄军高层对出兵车臣态度不一，反对者居多，官兵斗志不高，影响了战争的进程和结果。第二次出兵车臣，几乎得到了俄社会各界的广泛支持。究其原因，主要是极端民族分裂分子的恐怖行径使大多数俄罗斯人意识到必须尽快解决车臣问题，打击分离主义者和消灭恐怖分子，保持国家政治、经济生活的稳定。俄当局高举“反恐怖主义、维护国家统一”的旗帜，师出有名。
活用战法，巧妙应敌。俄军汲取了第一次车臣战争轻敌麻痹、急于冒进的弊端，采取稳扎稳打、步步为营、多路挤压的战法，将进攻与清剿相结合，强化占领区秩序与巩固战区后方相结合，不给车臣武装分子以可乘之机。行动中，机械化部队每日只推进10—15公里，每攻占一地，立即进行巩固。在完成对格罗兹尼的包围后，俄军没有急于进攻，而是封锁围困，使用空中打击使其断水断电，变成一座死城，为最后攻城创造了良好的条件。
当判断格市之敌有突围的迹象时，俄军又采用虚留生路、巧设伏击的战法，放他们从格罗兹尼西南撤出并进入山区，2000多名武装分子钻进了俄军的“口袋”，遭到毁灭性打击。
远程突击，精确打击。俄军利用航空兵、远程火炮和地对地战术导弹对恐怖分子的各种目标进行远距离、非接触性的打击，力求先消灭恐怖分子的活动基地，摧毁其通讯、交通、经济设施，使恐怖分子陷入瘫痪状态，再对其一网打尽。与此同时，俄军还充分发挥其在技术领域的绝对优势，运用大量精确制导武器对车臣恐怖分子进行精确打击。据外电报道，俄军使用了几十颗军用卫星保障此次军事行动，车臣恐怖分子的一切活动和所有固定目标都在俄军侦察飞机和侦察卫星的严密监视之下。作战中，俄航空兵在侦察卫星、侦察飞机实时提供情报的条件下，大量使用KAb500和KAb-1500精确制导炸弹、油气炸弹等对敌雷达、油库、电视台、武器弹药库、匪首住所等目标实施精确打击，以求尽量减少打击目标周围居民的伤亡。
1、加剧了俄罗斯上层统治集团的内部矛盾。
在出兵车车臣战争场景臣问题上，一向支持叶利钦的“民主派”内部产生严重分歧，“民主派”一些头面人物成为总统和政府的反对派。
在对车臣动武问题上议会也与总统对立。俄罗斯议会两院大多数议员一直主张用政治与和平方式解决车臣问题，分别在1991年11月10日、1994年12月8日反对或不批准总统对车臣实行紧急状态的法令。1995年4月12日，国家杜马以286票的绝对多数通过禁止在车臣用兵的决议，次日俄罗斯议会上院也以97票的多数通过了反对对车臣动武的决议。1995年6月21日，俄罗斯国家杜马又因车臣危机问题通过对政府的不信任议案。
军队内部对出兵车臣也发生尖锐矛盾。很多将领则持反对立场。陆军第一副司令员沃罗比约夫上将因反对出兵车臣毅然提出辞职。在第一次车臣军事行动中，持消极、反对态度的官兵为数很多。由此可见，俄军内部对车臣战争的矛盾和斗争激烈。
2、使民族矛盾更加尖锐和复杂。
车臣战争俄罗斯领导人以车臣人闹民族独立、煽动民族分离、破坏俄联邦国家统一为理由出兵惩罚，但在许多小民族来看，这是大俄罗斯民族欺压谋求民族独立自主的少数民族，从而使他们回想起历史上沙皇军队征服弱小民族的情景，因此不仅同情弱小民族车臣人，而且公开反对和遣责俄军进犯车臣。事实表明，俄罗斯政府采取的出兵车臣行动并未达到以惩罚车臣人来告诫其他少数民族，维护各民族统一和国家统一的真正目的。相反，更加激起高加索地区少数民族反对大俄罗斯的不满情绪，引起其他地区少数民族对大俄罗斯的高度戒备，从而使民族关系更加尖锐和复杂。
3、加深了俄罗斯的经济危机
1991年后，俄罗斯工农业生产持续大幅度下降，使经济处于深刻危机状态，俄军进攻车臣消耗了大量军费，使经济危机形势更加严重。从车臣逃亡的30多万难民需花费大量资金安置和救助，而重建变成废墟的格罗兹尼城市则需要5万亿卢布。车臣危机使俄罗斯经济形势更加恶化，经济继续大幅度下滑，通货膨胀居高不下，卢布持续大幅度贬值。到1996年8月俄罗斯和车臣达成和平协议，俄罗斯政府在车臣战争中耗费的资金约为50-60亿美元(约合3万亿卢布)，这对俄罗斯是一个沉重的负担。俄罗斯是独联体国家中经济基础条件最好和资源最丰富的国家，可是20世纪90年代以来经济形势却是比较差的国家之一，这在一定程度上与车臣战争的影响有关。
4、车臣危机使俄罗斯的国际地位下降。
俄罗斯出兵车臣，首先给独联体其他国家带来阴影，因为它们担心有一天会因得罪大俄罗斯而遭到大军压境的灾难。一些国家的反对派认为发兵车臣暴露了“俄罗斯帝国的本性”，反对本国政府与俄罗斯实行经济一体化。因此，除俄罗斯外，独联体的其他大部分国家均与北约建立了和平伙伴合作关系，积极发展与西方发达国家的政治和经济关系，这也是对俄罗斯的戒备。
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