两广总督，全称“总督两广等处地方提督军务、粮饷兼巡抚事”，是管辖广东、广西两省的最高军政长官。
清朝入关后的第一个两广总督，叫佟养甲。
佟养甲生于1608年，出身于辽宁抚顺一个富商家庭。当时，辽东一带汉满杂处，各种势力错综复杂。佟家作为商人，难免与各方势力都有生意往来，明朝朝廷也没有严格管理。
1616年，努尔哈赤建立后金政权。1618年，努尔哈赤在盛京宣读著名的“七大恨”檄文，率领两万步兵、骑兵向明朝发起进攻。此后，后金就与明朝处于战争状态。这时候，与后金做生意，就有“通敌”的嫌疑。偏偏佟养甲的堂哥佟养性见钱眼开，不顾朝廷禁令，依然与后金保持贸易往来，被抓走了。佟家随即投靠后金，带领后金军队攻陷了抚顺。
佟家投靠后金后，一部分被编入汉军八旗中的正蓝旗，一部分编入满军八旗中的正白旗。佟养甲属于汉军正蓝旗。他加入了清军，并于1644年跟随清军入关，成为清军统一全国的急先锋。
佟养甲与另一名明朝降将李成栋一起，从北京南下，攻克南京，摧毁了南明弘光政权。随后又进军福建，摧毁了南明隆武政权。接下来又转战广东，摧毁了南明绍武政权。
佟养甲因功，于1647年被任命为两广总督。
在对待南明政权方面，佟养甲堪称心狠手辣。在攻占广州后，佟养甲将隆武帝一家20余口全部杀掉。佟养甲诱降明朝大学士兼兵部尚书陈子壮，没有成功，恼羞成怒地将陈子壮活活锯死。南明抗清官员陈邦彦被佟养甲俘虏后，惨遭凌迟之刑。另一名抗清英雄张家玉也在东莞与佟养甲的军队血战而亡。
陈子壮、陈邦彦、张家玉号称“岭南三忠”，他们全都死在佟养甲手上。
佟养甲的残酷冷血，激起了广东民众的激烈反抗。不过，佟养甲没有死在抗清军队手中，而是被自己人所杀。
这个自己人，就是曾经跟随他征战南北的副将李成栋。
佟养甲与李成栋并肩作战，是同僚关系。可是，由于佟养甲的身份是汉军正蓝旗，属于清朝的“自己人”，而李成栋只是明朝降将。所以，当他们攻克广州后，佟养甲被任命为两广总督，李成栋则只担任两广提督。这样一来，李成栋不但无权过问地方行政事务，在军事行动上还得听从佟养甲指挥。
心高气傲的李成栋，忍不下这口气。1648年，当江西总兵金声桓、副将王得仁反清归明后，李成栋认为时机已经成熟，决定响应金声桓、王得仁的行动，反正易帜。
1648年6月，李成栋在广州发起兵变，宣布反抗清廷，归顺南明永历政权。佟养甲见形势不妙，被迫剪掉辫子，表示顺从李成栋。
后来，南明永历政权虽然将佟养甲封为襄平伯，挂了一个管理中军都督府事的职务，但手里并没有实权。他不甘心，上书朝廷：“疑臣则杀之，不疑则任之，何能郁郁居此?”永历帝下诏对他进行宽慰，但仍然不给予实际职务。显而易见，这是对他表示怀疑。
佟养甲很失望，怀念起清廷的宠信，便萌发了叛意。他暗中派人送信给清廷，说明广州兵变的前因后果，希望派遣清军南下广州，自己在广州做内应。没想到，这封信落到李成栋手里。
李成栋随即派佟养甲前往梧州，在半路上设下埋伏，将佟养甲杀掉，绝了后患。佟养甲时年40岁。
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