张居正去世以后，朝中大臣纷纷上书，指责张居正的各种错误。于是万历皇帝上书对张居正进行严查。夺去了万历皇帝曾经赐给张居正的各种玺书、四代诰命，甚至还一度准备对张居正进行开棺鞭尸。
虽然最终没有开棺鞭尸，但是查抄了张居正的所有家产，把张居正的所有亲属加以流放。有的饿死，有的病死，遭遇都极其悲惨。对张居正所提拔起来的那些官员，都纷纷给予夺官、降职、处死等各种处罚。
(张居正)
那么，万历皇帝究竟为什么要这样对待张居正呢?
显然，这是由于万历和张居正有非常多的矛盾，他们之间有不少过节。那么，他们之间，究竟有什么样的过节呢?
万历皇帝和张居正之间的过节，确实非常多。由于万历皇帝只是一个小皇帝，实际上也就是一个小孩儿。一个小孩子，显然什么事儿都不会做。所有的事情，都只能是张居正来做。这样一来，万历皇帝必然和张居正之间，要产生权力之争的矛盾。
也就是说，这个小皇帝他自己想做主，自己想表态。但是张居正又不肯同意他的那些表态。因为他的那些说法，都是不成熟的。可能只要别人在他面前撺掇一句，他就会表一个态。尤其是进入青春期以后，他会更加逆反，这是所有孩子的共同特征。如果这个孩子是皇帝，他的逆反会更加强，更加不会听张居正的话。
所以说，在万历皇帝成长过程中，他和张居正之间发生的矛盾，肯定是不少的。
除了这一点以外，万历皇帝的母亲李太后，也加速了万历皇帝和张居正之间的矛盾。为什么说他加速了万历皇帝和张居正之间的矛盾呢?因为万历皇帝这个人有些贪玩好耍，不好学习。这一点，也符合所有小皇帝的性格。如果这个孩子只是一个皇子，甚至太子还没有确定。那么这些皇子肯定会积极向上，认真学习，努力奋斗。目的就是要用自己优异的表现，来征服皇帝，让皇帝立他为太子。
(万历皇帝)
但假如这个孩子已经是小皇帝了。她已经获知，她具有无边的权力。那样一来，他肯定就觉得自己不用再争夺了。不用再争夺了，他也就不想积极进步了。所以就更容易贪玩好耍。
同时，小皇帝身边的那一大帮人，他们为了自己的前途，也会积极迎合小皇帝，讨好小皇帝。小皇帝想玩了，他们就会积极地配合他去玩。总之，小皇帝是很不容易把精力放在学习上的。
万历皇帝恰恰是这样一个贪玩好耍的皇帝。万历皇帝的母亲李太后，当年完全管不住他。管不到他，就用张居正来吓唬他。说，你要不好好学习，我就把张居正喊来，让张居正收拾你!而实际上，他也是这样做的，好多次都把张居正喊来，让张居劝说万历皇帝。
张居正只是一个大臣，他所谓收拾，其实也就是跪在地上，反复不断地求情，喋喋不休地说。用古代那些成功的皇帝，来激励万历皇帝。
张居正这样喋喋不休的说，肯定让幼小的万历皇帝非常讨厌张居正。
这样一来，张居正和万历皇帝的矛盾越来越多。
尽管如此，在万历皇帝已经成年，准备亲政的时候，张居正却在这个时候去世了。张居正既然已经去世，他其实也就不存在和万历皇帝之间的权力之争了。就算之前他非常愤恨张居正，但是张居正已经去世，这种憎恨应该就消失了。而且，如果这时候万历皇帝清算张居正的话，则显得他作为一个当皇帝的人，非常小气。总之万历皇帝清算张居正，似乎是没有必要的。
但说没有必要，可万历皇帝却清算了张居正。我认为，万历皇帝这样做，必然有他不得不这样做的理由。
(李太后)
那么张居正在已经去世的情况下，万历皇帝还要清算他，目的何在呢?
要理解万历皇帝的这种行为，我们得回过头去看看，历史上有一个人和他的情况是非常相似的。这个人就是汉宣帝，汉宣帝在当时的权臣霍光去世以后，他杀掉了霍光的一家人。他为什么会杀掉霍光一家人呢?原因就在于，霍光的一家人当时已经把持朝政，把整个朝廷都控制起来了。同时，由于汉宣帝对他们把持朝政这件事表示不满，因此他们蠢蠢欲动，想要对汉宣帝不利。而汉宣帝也借这个机会，把他们一网打尽。
万历皇帝和汉宣帝所面临的情况是差不多的。虽然张居正的子孙后代、张居正提拔的那些官员，形成了一个比较庞大的势力。虽然张居正的确已经去世了，但实际上由于这些人的存在，万历皇帝不会活得很痛快。
万历皇帝当然不愿意生活在张居正的阴影里，他当然想要自己做主。但如果是一个一个地打击，显然是不太容易的。如果先打击张居正，把张居正的影响消弭到最小，再收拾张居正的家人及追随者们，显然就容易得多了。
显然，万历皇帝的做法，依然是权力之争。
(参考资料：《明史》《明实录》等)
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