水族人浓厚的祖先崇拜观念，使他们格外注重丧葬仪礼，并在丧葬过程中保留着较为完整的原始信仰习俗。
水族的丧葬过程比较复杂繁纷，其主要程序包括报丧、入殓、择吉、安葬、立碑、除服用等六个阶段，其中不少具有水族的民族特点。家中老人咽气辞世后，家人要速派村寨里的小伙子，四出向亡人的亲戚朋友报丧。报丧的目的，既为让亲友有个精神准备，并速备下香烛、鱼、糯米、酒、布、钱等吊丧用物。同时，更重要的是使有血缘关系的人共同忌荤举哀棗除了鱼类之外的一切禽畜等肉类。这时，遗属还要将逝者铺床用的稻草和穿着过的旧衣服，搬到寨外烧掉。这一名叫“烧老窝”的习俗，说是让烟火之神将这些用物带给亡灵使用，实为一种消毒清洁的卫生习惯。即使有些要留用的东西，也得在火堆上用烟火薰燎薰燎。这一来，就算结束了死者的人间烟火生活了，不会将不吉的东西传给子孙后代了。
与此同时，家人要赶忙烧温水来洗遗体。据说，只有洗干净遗体，没有臭汗味，才能魂归祖地，与阴间的福先聚居在一起。洗尸体时，不能让死者的脚着地，因而要将死者放于竹编的米箩里，再用温水自上而下的擦洗。洗尸水要倒在没有人过往的地方，千万别让人踩上此水，否则，认为他的脚会开裂的。
洗净尸体后，再将遗体另置干净的米箩上(如能置于铜鼓上，将更为荣光)，为之穿上寿衣。寿衣要3件、5件等单数棗倘若是年轻媳妇死了，则要等娘家来人验看。装殓要让逝者平躺棺内。切忌头高脚低，可见其脚部，否则会变鬼作崇云云。装殓时，还要让逝者口含银钸，手拿纸钱，头垫纸钱。
此俗说是为了使逝者走入阴间时，才有钱去买水喝、买东西吃。为亡人穿寿衣及放置随葬物时，应格外小心，所有衣物都不能着地。倘不慎掉落地上，要另换新的，否则亡灵便收不到。此外，装殓时切忌呼喊活人的姓名，以避免亡灵将所呼喊者的灵魂勾去。
不论是为等待至亲验尸，或停尸待殓，还是装殓后的祭悼期间，为防止亡灵作祟和黑猫跨过遗体而发生意外，治丧时都要安排人员守灵。守灵时，除丧家外，村邻皆依俗主动前来帮忙。为了冲淡悲哀气氛和消除恐惧心理，守灵者或聚而摆古，或跳芦笙舞、唱花灯戏，或进行顶杠等民间竞技活动。
治丧期间，水族还有俗称“开控”的活动，即设置灵堂，祭掉死者。“开控”的时间可长可短，规模亦看家庭境况而有所不同。“开控”要在灵前点香焚纸，摆设鱼、豆腐、酒、饭等祭品。殷富人家还要悬挂3或5、7面铜鼓，再配上锣、钹，昼夜敲击。民间认为，铜鼓声有上通天神、下达海龙的神力，可令神仙来给亡灵安慰和指路，使逝者上天成仙或入海为龙。“开控”期间还要聘请谙熟水族社会历史和迁移路线以及死者生平的水书先生，请他们在铜鼓、锣拔和芦笙、唢呐伴奏下，颂扬逝者的一生和为人处事，吟唱水族祖居和迁移路线，祈祝逝者再顺江而下，魂归祖先的老住地。
水族治丧期间，还特别讲究忌荤吃素。除了鱼等水产品外，在未入葬前所宰杀的家禽家畜皆称为“南得宇”，丧家及其同一血缘的人都不能沾腥，更不得吃“南得宇”，丧家及其同一血缘的人都不能沾腥，更不得吃“南得宇”。
违者必遭村人谴责。此俗原为吃素祭祖，以示哀痛。后来给抹上了迷信色彩，说是在治丧期间吃了荤，会给家庭招灾惹祸，家庭成员中会有人伤残或早夭。只有等到安葬过后3天，才可开荤。这时，先得杀一只鸡供祭逝者灵位，再用鸡血冲水漱口之后，方可开荤。
水族对安葬也十分讲究，规矩甚多。寿终正寝者皆为土葬;而非正常死亡者(如产妇因难产而死)，要先火化之后，再行土葬。安葬要请水书先生来选择吉日。由于葬期有早有晚，因而葬式也有便葬、急葬、深葬、假葬之分。便葬是不举办“开控”的悼念活动就安葬。急葬则因条件所限来不及祭悼就埋葬。深葬有两种形式，一是葬地、葬时都顺吉如意，丧家一次挖掘墓穴，让棺木全部落穴埋葬，此后不再动土的;二是葬地、葬时虽然可以，但尚有一些凶煞，这时得在墓穴上铺些木板，将棺木垫隔悬空起来，使其不完全落土。
等到吉日良辰时，举行一番祭悼活动后，再抽掉木板，使棺木落入穴里，埋土为坟。这种二次葬式，俗称浅葬。假葬则是一时难以择到安葬的日子，便将棺木抬往寨外，垫于木头上，再搭盖一座临时草棚为护。于是，或挖一土饼放在棺木上，或用木板围住棺木，再挑土复盖之，借以象征已入葬。到了吉日，再行土葬。如今这种假葬已少见了，一般多用浅葬代替之。
出殡前夕，丧家还要请巫师和水书先生来打斋，打斋要宰一头牛，并听任牛血流往遍地。水族民间认为，牛血是阴间的水，这一来便可让逝者在阴间有牛耕田、有水插秧，可得安生。有的地方在撒秧前，还要将神圣的枫叶放在田边一角，并划出一小块田为死者耕种之地。民间认为，这样便可以得到先人的保护，丰收有望。
水族每个由血缘系统组成的村寨，都有一个公共墓地，水族人的墓室很有特色：用石柱、石板、石条垒砌的长方形墓室，多为二三层，底层埋于土中，放置棺木，中上层露出地面，高1~2.5米，里面放了各种随葬物。
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