始建国元年(公元9年)，王莽篡汉建立新朝，便使安阳侯王舜去向太后索取玉玺，王政君怒骂：“你们父子一家承蒙汉家之力，才能世世代代都得到富贵，既没有报答他们，又在他人托孤之时，趁机夺取国家，完全不顾恩义之道。为人如此，真是猪狗不如，天子怎么会有你们这种兄弟!而且如果你们自以为得到天命而成为新皇帝，想要改变正朔服制，就应该自己做新的玉玺，流传万世，为何想要得到这个亡国的不祥玉玺?我不过是个汉家的老寡妇，随时都可能会死去，所以想要拿这颗玉玺陪葬，你们终究是得不到的!”王政君随即痛哭流涕起来，旁人以跟着垂泣。
王舜虽感到悲哀，但过了许久还是说：“臣等已经无话可说了，但王莽仍然一定要拿到传国玉玺，太皇太后您能到死都不拿出来吗?”王政君知道王莽是要威胁她，便将传国玉玺取出、砸到地上给王舜，为此传国玉玺还崩碎了一角，并说道：“我已经老死了，有你们这样的兄弟，我们王家今天是要灭族了!”王莽得到玉玺后非常高兴，在未央宫为王政君置酒设宴，大肆庆祝。
后来又改王政君称号为“新室文母太皇太后”，并说既然汉朝已灭，太皇太后不得再侍奉元帝，遂毁元帝庙，改为“文母篹食堂”，因为王政君还在世，不便称庙，便称为长寿宫。
王莽置酒请王政君到长寿宫，王政君前往，见元帝庙已被废弃，大惊，她哭着说：“这是汉家的宗庙，皆有神灵存在，是犯了什么罪让你毁掉!假设鬼神无知，修庙有什么用?如果有知，我原本是人家妃妾，怎能辱没先帝之庙来做为我用食的地方?!”她又私下向左右侍从说：“此人侮慢神灵，怎能长久得到上天保祐!”于是酒会不欢而散。
自从王莽篡位后，知道王政君怨恨自己，常常刻意讨好王政君，但王政君却越来越不高兴。
王莽将汉朝制度都改去，而汉朝本来穿黑貂衣，王莽就改为穿黄貂，又将汉正朔伏腊日也改去，但是王政君却命令自己的官属穿黑貂衣，并且在汉朝的正腊日时独自与左右一起相对酒食。
始建国五年(公元13年)，王政君逝世，年八十四岁，与汉元帝刘奭合葬渭陵，王莽并诏扬雄作诔。
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