说法一：禁卫军活活勒死的
锐意尽失的隋炀帝晚年常引镜自照，对萧后和臣下说：“好头颈，谁当斫之!”
然而，当隋炀帝死的那天来临的时候，禁卫军哗变了，隋炀帝怕被杀头，便从身上解下一条绢带，递给禁卫军头领，让他把自己活活勒死了，死时年仅50岁。同时被处死的还有他的两个儿子和一个孙子。隋炀帝死后，肖皇后和宫人用床板做了三口小棺材，将其装硷，草草埋葬了。后来，江都太守陈核又把他改葬在江都城西的吴公台下，以后又移葬雷塘。
民间传说，因隋炀帝作恶多端，他葬在哪里，雷就轰到哪里。隋炀帝墓后来渐渐荒芜。直到清朝嘉庆年间，才被住在雷塘附近的扬州学者阮元发现，现陵前有阮元重修时所立的碑，碑上刻有当时的书法家、扬州知府伊秉授所书"隋炀帝陵"四个大字。
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说法二：被叛军宇文化及所弑而终
南朝后主是在隋炀帝即位那年即604年死去的，当时，这位雄心勃勃的新皇帝赐给死去的陈后主一个贬称"炀"，意思是说他一生贪图花天酒地而荒疏了政务。显然，他是在嘲弄这个亡国之君。但是，没想到，14年之后，隋炀帝自身，也被大家称为了“隋炀帝”。
大业十四年三月十一丙辰日(618年4月11日)，隋炀帝于江都被叛军宇文化及所弑而终。隋炀帝死前，宇文化及煽动叛军将之包围，炀帝闻变，仓皇换装，逃入西阁。被叛军裴虔通、元礼、马文举等逮获，炀帝说：“我实负百姓;至于尔辈，荣禄兼极，何乃如是!今日之事，孰为首邪?”化及命令封德彝宣布炀帝罪状。炀帝说：“卿乃士人，何为亦尔?”德彝一时惭愧退下。
隋江都太守陈棱找到炀帝灵柩，粗备天子仪卫，改葬于江都宫西吴公台下，当时牺牲的王公，皆埋葬在炀帝坟茔的两侧。唐平江南后，以帝礼改葬雷塘。
扬州发现隋炀帝陵引关注沉睡千年众多谜团待解
隋炀帝陵墓在扬州被意外发现，引起全国考古界和广大读者的广泛关注。2013年4月15日，扬州市文物局召开新闻发布会，正式宣布两座墓葬中已经发掘的那座为隋炀帝陵。
墓志确定墓主为隋炀帝
位于扬州邗江区西湖镇司徒村曹庄的考古工地上，考古人员正在用蓝色彩钢将古墓周边围挡起来。考古工地位于一个房地产开发项目上，由于发现重大，目前考古工作已经暂停，待专家论证后再对另一座墓葬进行发掘。
新闻发布会上，扬州市文物考古研究所所长束家平介绍，去年底工地施工时就发现了少许古代碎砖，但因为建筑垃圾太多，难以开展考古工作。今年春节后，工地全面平整土地，考古队进场，通过勘探发现了两座砖室古墓。已经发掘的隋炀帝墓包括墓室、耳室和甬道，长8.2米，宽约5米，只能算中小规模的墓葬，当时并没想到这居然是座帝陵。
他说，隋炀帝陵历史上被盗过，加上以前民房就建在墓葬上方，因此墓顶遭到了破坏，在墓葬内，考古人员发现了铜铺首、玉腰带、铜钱和铁钉等十几件文物，数量虽少，但等级很高。
证明墓主身份最有力的证据是墓志，上面清楚地写着“隨故煬帝墓誌”，墓志中“隨大业十四年”正是隋炀帝被叛军缢死的公元618年，而“帝崩于扬州”“……于流珠堂”，清楚写明皇帝杨广死后萧后埋葬他的地点。正是根据这些内容，专家们认定墓主为隋炀帝。
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相距5公里留下千年谜团
这处考古工地位于扬州西部，而之前被公布为文保单位的隋炀帝陵是在城北槐二村，两者相距约5公里。槐二村所在的雷塘，正是唐朝为隋炀帝修建的陵墓所在地。
史料记载，隋炀帝死后，最初由萧皇后将其葬在江都宫流珠堂，后大将陈棱感念其恩，将其葬在吴公台下。唐朝建立后，唐高祖李渊以帝礼将其陵迁至雷塘。束家平在发布会上说：“隋炀帝在唐初改葬雷塘有明确记载，但现在墓地却在5公里外的曹庄被发现，其中的缘由还有待考古发掘去解决。这里究竟是不是吴公台，和江都宫、雷塘到底是什么关系，目前仍然是个谜。”
由此推论，此处是否就是李渊为杨广新修的陵寝，尚有待考证。根据记载，萧皇后去世后，唐太宗李世民将其遗体送到江都与隋炀帝合葬，如果考古证明另一座墓的墓主是萧皇后，那么，基本可断定这里是杨广最后的安息地。
最让考古人员关注的，还是那块墓志，断定墓主身份的关键字很清晰，但是绝大部分字体已很模糊，难以识读。杨广在历史上名声很差，说到他就让人想起弑父杀兄、荒淫残暴、劳民伤财的暴君形象。然而在史学界，隋炀帝是一个功过是非很复杂的人物，在他刚刚死去的时代，尤其是夺得天下的李唐王朝如何评价他，这块墓志无疑可提供新的史料。目前扬州市文物局正在联系科研院所，试图通过科技成像技术，解开墓志文字之谜。
李渊为何给隋炀帝修帝陵
众所周知，隋炀帝这个谥号正是唐高祖李渊加给杨广的。在谥法中，“炀”的意思有去礼远众、逆天虐民、薄情寡义、离德荒国等多种含义，明显是个恶谥。但是李渊又以帝王的规格，为隋炀帝修建了陵墓。这是为什么?
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南京大学历史系教授张学锋分析说，在魏晋南北朝时期，汉族政权的更替总要走一个禅让的形式，王莽、曹丕都是这样做的，宋代以后才是通过征伐直接推翻。公元617年，李渊攻入长安，立杨广的孙子杨侑为帝，遥尊杨广为太上皇。杨广去世2个月后，李渊逼杨侑将帝位禅让给自己，建立了唐朝。禅让的形式表明，唐朝承认隋朝的合法性和杨广的皇帝身份，因此才以帝礼安葬杨广。
此外，杨广和李渊本身就是表兄弟，二人的母亲是亲姐妹。中古时期是世家大族占统治地位的时代，也可以说是贵族的时代，门阀观念、家族观念很强，因此李渊为杨广修陵是合情合理的。
有专家认为，杨侑墓在今陕西扶风县，墓葬封土为覆斗形，这是皇帝和王侯墓葬的封土形制，隋炀帝陵也应如此，而被清阮元考证为隋炀帝陵的槐二村大墓，封土为馒头形，那应是一座汉墓。
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