袁崇焕在明朝已经被盖棺论定，他的罪名也是经过八个月的审判，最后才被处死，并没有冤枉他。到了清朝，乾隆皇帝一句“平反”，一帮子文人、史官们就忙活起来，为袁崇焕的死辩解，把其封为民族英雄，这才出现了争论。
崇祯皇帝启用袁崇焕为辽东统帅，因为他之前在宁远的时候，两次击败努尔哈赤、皇太极的后金军队，所以皇帝很信任他。他在大殿上提出‘五年复辽’的目标，私下里却对大臣说他这只是安慰安慰皇帝，等到他到了辽东，第一步就杀了毛文龙。
天启皇帝、崇祯皇帝都是非常信任毛文龙的，还给了他尚方宝剑，说明毛文龙的战略地位是很重要的，后金占领的辽东地区，只有毛文龙一人深入敌后，建立了根据地，说明了他是有本事的。努尔哈赤、皇太极多次试图消灭毛文龙，都没有成功。毛文龙部队的军饷除了朝廷的供应，他也靠做贸易解决。宁远的粮饷全部靠朝廷，不给就发生兵变，总兵朱梅被捆绑，巡抚毕自肃被逼自杀。
计六奇《明季北略》：“崇焕捏十二罪，矫制杀文龙，与秦桧以十二金牌矫诏杀武穆古今一辙。”
毛文龙死后，皇太极立刻突破长城，杀到北京城下，袁崇焕作为辽东统帅负有不可推卸的责任，袁崇焕在蓟州的时候，崇祯皇帝把勤王总指挥的权利给了他，他也保证绝对不会让后金越过蓟州，但是他做不到，军事情报做得非常糟糕，皇太极的军队竟越过袁崇焕的防区，他一点也不知道，真是“两岸猿声啼不住，轻舟已过万重山”。
袁崇焕的性格是很暴躁的，跟大臣和将领的关系也很紧张，像满桂在宁远就待不下去，只好来到山西大同。赵率教带领的援军，三屯营总兵朱国彦不让他进，这也是其中的一个原因。张岱《石匮书后集》：“袁崇焕短小精悍，形如小猱，而性极躁暴”。
崇祯皇帝让袁崇焕任辽东统帅，是希望他收复辽东，最起码的底线是维持现状，不能让局势恶化，结果他杀了毛文龙，清军失去了后顾之忧，多次入关，烧杀抢掠，无恶不作，多少老百姓妻离子散，家破人亡。袁崇焕的死，和老百姓的死，谁更值得同情?
袁崇焕根本不是皇太极的对手，他的军事思想比较单一，凭坚城，用大炮是不能御敌于国门之外的。比起袁崇焕，中国历史上的名将众多，秦朝的蒙恬，赵国的李牧，汉朝的李广、卫青、霍去病，南宋的岳飞、刘琦，明朝的李成梁、李如松、戚继光，这样的人才值得我们崇拜，“但使龙城飞将在，不教胡马度阴山”。
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