《孤舟》的大结局揭示了王明忠牺牲的真相，同时也洗清了肖君侠作为叛徒的嫌疑。黄秋收在生前曾向顾易中提到，如果他牺牲或双方失去联系，组织会指派新的联系人。他将一本诗集交给顾易中，作为联络凭据。然而，黄秋收牺牲后，顾易中未能等到新的联系人。原本组织安排王明忠与顾易中会面，但王明忠在见到顾易中之前就被90号逮捕了。
王明忠的行踪在抵达苏州后被泄露，迅速被张吉平逮捕。这表明组织内部出现了新的叛徒。许多人怀疑肖君侠是叛徒，但他在拜访顾易中时并未携带诗集或透露接头暗语，表明他不是组织指派的联系人。肖君侠确实希望与顾易中建立联系，以帮助他们在苏州的项目，但这并不涉及背叛。
实际上，出卖王明忠的是其联络员雨生，他收取了特工的款项并泄露了王明忠的身份和位置。另一方面，肖君侠被周知非囚禁后，最终被顾易中救出。周知非没有立即处决肖君侠是因为他想从肖君侠那里谋取利益。肖君侠不会成为叛徒，因为他家庭富裕且受过良好教育，他的家族成员都参与了抗日斗争。
此外，张海沫在剧中扮演了重要角色，她不仅帮助顾易中稳固了与小野的关系，还在关键时刻提醒顾易中保持冷静。她甚至卖掉自己的珠宝来资助顾易中的事业。抗日战争结束后，顾易中被误认为是卖国贼，张海沫四处寻找证人和物证来帮助他澄清身份。她明白顾易中心念肖若彤，因此在为顾易中辩护后选择离开，没有纠缠或勉强。张海沫与顾易中的假结婚是为了帮助他完成任务，驱逐敌人，守护家园。她的坚定勇敢同样值得赞赏。
