在《孤舟》这部作品中，李先生被日本人毒杀身亡，这一事件对故事的发展产生了重大影响。
当玉卿得知周知非被捕的消息后，她心急如焚地赶往李先生处寻求帮助。然而，她到达时只见到李先生因中毒而病重卧床，李太太坦言李先生目前也是自顾不暇。面对这种情况，玉卿毅然决定前往南京寻求援助。
近藤正男得知玉卿的行动后，心生警觉。为了防止局势发生变故，他急召顾易中，命令其立即执行周知非的枪决。周知非临刑前，恳请一见李先生。盐井考虑到周知非将死，最终允许了他的请求。在与李先生的最后一面中，周知非得知了是近藤正男暗中下的毒手。李先生以微弱的声音托付周知非，务必寻回李太太和重要物品。周知非似乎有所领悟，归途中他再次请求盐井，希望能够归家一叙。后来，周知非成功逃至重庆，并得到了戴老板的亲自接见和高度重视。
随后，苏州的局势发生了变动。七十六号特工总部主任李先生去世，原九十号特工站站长周知非逃窜不知所踪。顾易中出任政治保卫局苏州分局局长，这一系列事件为故事的发展带来了新的转折和挑战。
总的来说，李先生的身亡不仅是对故事中人物关系的一次重大冲击，也为后续的剧情发展埋下了伏笔，展现了《孤舟》中错综复杂的政治斗争和人物命运。
