1614年因“归服益广”将四旗改为正黄、正白、正红、正蓝，并增设镶黄、镶白、镶红、镶蓝四旗，合称八旗，统率满、蒙、汉族军队。正黄，镶黄和正白旗列 为上三旗，上三旗 内无王，都归皇帝所亲统.兵是皇帝亲兵，侍卫皇室的成员也从上三旗中选。正黄、镶黄、正蓝(后由多尔衮将正白旗代替正蓝旗成为上三旗)三旗，由皇帝自将，称为上三旗，余下五旗称为下五旗。正蓝旗在顺治前与正黄，镶黄列为上三旗，顺治初，被多尔衮降入下五旗，不再由皇帝所亲统而由诸王，贝勒和贝子分统。镶黄、镶白、镶红、镶蓝类似!
简单地说，清八旗制度是清政府建立的一种军事组织制度。
八旗的旗，满语为gusa(固山)，意为旗分(指一种军制)，并不是我们平时所认为的“旗帜”。一个旗分，分为汉军，满洲，蒙古三旗。
在旗分(固山)之下，有jalan(甲喇，意为参领)作为其低一级别的军事机构，在甲喇之下又有niru(牛录，意为佐领)作为其更低一级别的军事机构。
所以我们可以把“旗”理解为现代部队的“师级”。旗主，参领，佐领分别对应师长，旅长，营长，满语为固山，甲喇，牛录
其实清八旗的形成不是一蹴而就的，它有个循序渐进的过程，上面我所讲述的内容只是最后成型的状态，在漫长的演化过程中，清八旗制度也是从最开始的两旗，到三旗，到四旗逐渐演变而来的。
二旗时期
最开始努尔哈赤时期，满人只有二旗，分别为努尔哈赤统领的黄旗和舒尔哈齐(努尔哈赤弟弟)统领的黑旗，两旗人数相当
而这里的黑旗就是日后八旗成型时蓝旗的原型，至于后来为何改了颜色，并没有统一的说法，一般认为是因为黑旗不利于在夜间辨识。
三旗时期
后来在1601年，努尔哈赤吞并了海西女真四部之一的哈达部，将哈达部编为白旗，由自己的大儿子褚英和哈达部首领(后来被废)作为旗主共同管理。
此时便形成了黄旗，白旗，黑旗的三旗局面，史称“三固山”时期。
四旗时期
1609年，蓝旗旗主舒尔哈齐被努尔哈赤囚禁，蓝旗势力也被努尔哈赤一分为二，独立分出红旗，由自己的二儿子代善作为旗主管理。剩下的部分保持蓝旗不变，由舒尔哈齐的二儿子阿敏管理。
1611年，努尔哈赤又囚禁了自己的大儿子褚英，任命第八子皇太极和长孙杜度共同管理白旗。
由此，四旗制度的格局正式成型。
八旗时期
1615年，在努尔哈赤的不断征伐吞并之下，满人军队人数得到了极大的扩充，于是下令将四旗分为八旗。
即黄旗分为正黄，镶黄二旗，皆为自己统领，红旗分为正红，镶红二旗，分别由代善和他的儿子共同统领。
白旗分为正白，镶白二旗，分别为皇太极和杜度统领。蓝旗分为正蓝，镶蓝二旗，分别由莽古尔泰(努尔哈赤第五子)和阿敏统领。
由此，清八旗制度正式建立成型。
努尔哈赤之后的皇太极，顺治执政时期，八旗制度又经历了多次旗主的替换变革，最终形成了皇帝亲自统领正白，正黄，镶黄三旗，各亲王分别统领正红，镶红，正蓝，镶蓝，镶白五旗的局面。
由此便诞生了我们耳熟能详的“上三旗，下五旗”的说法。
一般上来说上三旗和下五旗的旗人待遇上并没有什么差别，但是上三旗是由皇帝亲自统领的，所以该旗的旗人只需对皇帝负责，而下五旗的旗人要对王公贵族和皇帝共同负责，在礼制上要略低一等。
所以毫无疑问，皇帝的出身肯定是出于上三旗的，有一些下五旗的王宫贵胄，亲王嫔妃在取得很高的权势之后，也可以进入上三旗，俗称“抬旗”。
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