“清末四大奇案”是指在慈禧掌权的清朝末年，即同治、光绪时期在中国发生的比较奇特和复杂的四个案件，一般认为四大奇案为张汶祥刺马案、杨乃武与小白菜案、名伶杨月楼冤案、太原奇案。
清道光年间，山西太原阳曲县有一富商张百万。富商张百万劳碌一生辛辛苦苦积累下了百万家产，可惜他却膝下无子，只有两个如花似玉的两个宝贝女儿：张金珠和张玉珠。
为了两个宝贝女儿的生活能够幸福，在金珠和玉珠很小的时候，张百万就为小姐妹俩指腹为婚安排了结婚对象，都是当地门当户对的大户人家。
大女儿顺利地按当初指腹为婚约定的对象嫁了出去，张百万只操心自己的二女儿玉珠的婚事。当初玉珠指配结婚对象是曹家的公子曹文潢，可世事无常，曹文潢数次科举考试都名落孙山落榜了，再加上曹家已经大不如前家道中落，根本就没钱了
原本想靠着和曹家联姻来发展自己的事业张百万本，自然不能把自己的宝贝女儿玉珠，嫁给一个朝不保夕的曹文潢。张百万将其二女改许配与一个姚姓大户人家，并约定了过门的日子。
张玉珠心中早就对自己的男人曹文璜情有独钟，一颗芳心早就系在其身上。当她听说了父亲张百万将自己另许他人时，她马上派人通知了曹文璜商议对策。
两人商议了许久，决定一起出逃私奔，并前往交城县投靠在交城县当县令的友人陈砥节。
两人商议好后，稍稍收拾了一些细软，便一起相互扶持着上路出逃。曹文璜和张玉珠两人知道仅仅依靠自己步行，肯定逃不远，会被张百万派人追回，不由得暗暗着急。
曹文璜和张玉珠两人逃跑路上，途经一间豆腐铺。豆腐铺莫姓老汉听说了两人的遭遇后，很是同情他们两人，于是豆腐铺莫姓老汉借给他们两人一头毛驴，帮助两人快速逃走。
到了约定过门的日子，张百万才发现自己的宝贝二女玉珠已经失踪。他根本就没有想到自己的女儿会和情郎出逃私奔，以为玉珠可能躲藏在大女金珠家里。
张百万带着人前往金珠家里，寻找自己的二女儿玉珠。这个时候，他的大女儿正和一名和尚在房间里做不苟且之事，听到有人打上门来，金珠慌忙将和尚藏到衣柜中，并把衣柜门关了起来。
张百万进到张金珠房间后，当然没有找到玉珠，他看到金珠遮遮掩掩的样子后，又听到衣柜中有响动，便理所当然地猜测自己的二女儿玉珠藏身衣柜内。
他觉得这种丑事不宜多声张，于是叫下人将衣柜和衣柜中的积淀一起抬走。衣柜抬回家中之后，张百万将下人支开，打开了衣柜，不由得大吃一惊，看到里面藏的是一名已经昏晕过去了的和尚。由于衣柜门关闭得太紧，空气不够，这名和尚缺氧已经昏晕过去了。
张百万看到这名紧闭双眼，直挺挺倒在衣柜里的和尚，以和尚已死。于是张百万悄悄替和尚换上二女儿玉珠日常所穿的衣衫，对外扬言其二女玉珠已病死。随后张百万设置下了灵堂，祭奠自己的二女儿，悄悄将昏晕过去的和尚当作死人送上了灵堂之中。
后来，这名和尚呼吸到了新鲜空气，慢慢地苏醒过来，发现自己莫名其妙地躺在灵堂之上，吓了一大跳，赶紧悄悄从灵堂之上溜了出去逃走了。
这个花和尚穿着女人的衣衫，肯定不方便。他在出逃的时候，经过莫姓老汉的豆腐铺，于是他在躲在这里，悄悄地换了一身男人衣服，将玉珠的女子衣衫扔在了豆腐铺。
这个花和尚原本就和张金珠有来往，被张百万打断之后，心里很不舒服。他从莫姓老汉的豆腐铺逃出来之后，看到路边有一个漂亮的妇女，于是他色心又起，上前调戏这个妇女。没有想到这个妇女是有夫之妇，他老公是一名以杀猪为生的吴屠户。
吴屠户看到自己的老婆被人欺侮，大为生气，便提起杀猪刀几下子就将这名花和尚给杀死了。吴屠户和他老婆看到自己惹下了人命官司，便两人合力将这个花和尚给弃尸于村外的一口枯井内。
一个偶然的机会，有人在村外的枯井里发现了花和尚的尸体并报官，再加上张百万家的下人，传出了张家灵堂上的张玉珠尸体失踪。这两件事情一时在太原阳曲县全城沸腾。
阳曲县令杨重民接到了报案后，马上下令开堂公审这两件案件。阳曲县令杨重民听人说起，花和尚原来身上穿的张玉珠衣物，在莫姓老汉家开的豆腐铺发现。
杨重民为求早日结案，草率将莫姓老汉视为凶手，并屈打成招，上报刑部以结案。
和张玉珠两人乘坐小毛驴到交城之后，在交城安顿下来。曹文璜返到太原，打算将毛驴归还莫姓老汉。他在路上碰到了吴屠户。原来吴屠户杀死了和尚后，打算搬往晋祠，途中遇上曹文璜，吴屠户酒后向曹泄露他为和尚命案中真正凶手。
曹文璜这才知道了曾经帮助过自己夫妇俩人的莫姓老汉遭到了诬陷。他心急火燎地赶回到阳曲县替莫老汉申冤，岂料县令杨重民得悉错判后，反诬陷曹文璜为帮凶。
张玉珠的丫环秀香在探监时得知事件真相之后，于是就赶赴交城寻访玉珠，其时曹文璜和张玉珠投靠的陈砥节，正巧升任山西提刑按察司。
在山西提刑按察司陈砥节的勘察之下，这两件案子最终才终于真相大白。命案中真正的凶手吴屠户被绳之以法，而无辜的莫老汉和曹文璜被无罪释放。
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