徽派建筑与赣派建筑有不少的相似之处，两者的相同点都有马头墙，内部结构也非常相似，有前后进，有天井，两侧有厢房，正厅前有门厅，大门外有照壁，那么他们之间的不同之处大致可以分为以下三点：
一、建筑形式
平面布局基本相同，“四水归堂”是常规设置，所不同的是赣派建筑的“井”略微大些，赣派建筑基本都是一层，徽派建筑一般都是两层，这与地形宽裕的赣抚平原和用地局促的徽州六邑地形地貌有关。赣派建筑外墙为青砖马头墙，而徽派建筑一般都白璧马面墙。徽派白璧马头墙小于赣派建筑青砖马头墙。
赣派建筑民居都是贴立穿斗式为主，祠堂官厅等大型建筑，多采用抬梁式，部分地区使用插梁式。内为木结构承重，四面外墙围闭，使建筑成为一个整体。
徽式宅居结体多为多进院落式集居形式(小型者以三合院式为多)，一般坐北朝南，倚山面水，讲求风水价值。布局以中轴线对称分列，面阔三间，中为厅堂，两侧为室，厅堂前方称天井，采光通风，院落相套，造就出纵深自足型家族生存空间。民居外观整体性和美感很强，高墙封闭，马头翘角，墙线错落有致，黑瓦白墙，色彩典雅大方。
二、年代历史
赣派建筑和徽派建筑从文化角度考证都与客家风水文化有关，江西是形势派风水文化的发祥地，因此可以考证赣派建筑年代上早于徽派建筑。但是，徽派建筑基于徽州文化的影响，徽州文化在明清时期发展很快，赣文化这一时期略显落后，建筑上不可避免受文化的影响。
赣派建筑成型于唐、宋朝，兴盛于明清，伴随着江西社会经济发展，科举人文和赣商崛起而不断发展壮大。晚清后期，随着太平天国运动、赣商衰败和社会经济衰退，赣派建筑趋于保守和逐渐没落。赣派建筑是主要集中于赣抚平原、吉泰盆地和赣南山区。
古徽州盛行敦本敬祖之风，各村均建祠堂，且有宗祠、支祠、家祠之分。据《寄园寄所寄》载：“聚族而居，绝无一杂姓搀入者。其风最为近古。出入齿让，姓各有宗祠统之，岁时伏腊，一姓村中千丁皆集，祭用朱文公家礼，彬彬合度。”
历史上徽商在扬州、苏州等地经营，徽派建筑对当地建筑风格亦产生了相当大的影响。徽派建筑坐北朝南，注重内采光;以砖、木、石为原料，以木构架为主。以木梁承重，以砖、石、土砌护墙;以堂屋为中心，以雕梁画栋和装饰屋顶、檐口见长。
三、村落规划
赣派和徽派建筑都受形势派风水文化影响，开天门、闭地户、水口建筑等布局基本一致，都比较注意“天人合一”与环境融为一体的风水观，所不同的是赣派建筑村落一般将祠堂、戏台置于村落的地理中心位置，而徽派建筑则将其作为水口建筑置于村口。
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