为拜会老友，访求典籍，安排历算著作的刊刻，梅文鼎于72岁再度出游，漫游路线与十多年前大致相同，先是接受福建落台的邀请一同入闽，取道武夷山侧，一路追寻先贤遗迹，观赏游览。因为李安卿等老友都在北京，他南下只见到历算名家林侗人，于是，梅文鼎复改道北上，游历了齐楚吴越，到了河北，直隶巡抚李光地的府邸由河北的大名迁至上谷，梅文鼎应老朋友之邀，在上谷兴致勃勃地住了下来，一边指导李光地之子李钟伦研究数学，一边整理旧作，著述新篇。这段时间，李光地先后为他安排刻印了《历学疑问》、《三角法举要》、《交食蒙求》等九种著作，由此可见他们的友谊之深。
1705年，康熙皇帝南巡，李光地以抚臣的身份雇从。他曾经向康熙推荐过梅文鼎的《历学疑问》，康熙提出这次南巡回来时要召见梅文鼎，于是在这年4月，李光地陪同梅文鼎在德水的御舟中拜见了康熙皇帝一连三日，康熙与这位大科学家促膝长谈，详细地询间关于历算研究的种种情况，不仅设宴款待梅文鼎，在临别时，还挥笔写下“绩学参微”四个颜体字送给他，这便是梅文鼎的书房名为“绩学堂”的由来。康熙皇帝对李光地说:“历象算法，联最留心此学，今鲜知者，如梅文鼎真仅见也。其人亦雅士，惜乎老矣。”
因为梅文鼎年事已高，康熙皇帝下诏给两江总督，调梅文鼎的孙子梅压成供奉内廷，钦赐监生，在蒙养斋任编汇官。次年又钦赐举人，两年后再赐进士.有一次，康熙皇帝在召见梅压成时说:“汝祖留心历律多年，可将《律吕正义》寄一部去令看，或有错误，指出甚好.夫古帝王有都、俞、吁、弗四字，后来止有都、俞。即朋友之间，亦不喜人规劝。此皆是私意。汝等须要竭力克去，则学问自然长进。可将此意写与汝祖知道。”康熙皇帝希望梅氏祖孙坦率、真诚地与他研讨学问，宁可直谏己过，不必以虚文掩饰。这是一位中国历史上罕见的热心科学的帝王，他与一位民间科学家之间因探讨学间而产生的友情与信任，令人赞叹。
康熙四十五年(公元1706年)，梅文鼎遇到了他丧妻以来的又一次沉重打击，他的得意门生李钟伦英年早逝，接着，儿子以燕也先他而去.白发人送黑发人，梅文鼎心力交瘁，大病一场，所幸李府医疗条件甚好，加上梅文鼎心胸开阔,3个月后，又恢复了健康。病愈以后，梅文鼎即南归故乡。在他生命的最后15年中，他仍然一如既往地与学者研讨学问，潜心整理平生所著历算书稿，终老不倦。
在故乡柏视山口，梅文鼎一方面是身怀绝学的科学家，另一方面是极受乡邻敬重的族长。所以，回到故乡，他竟以读书治学同徉的态度来管理族中事务。他极为重视编修族谱，主张依照苏、欧谱法修订，如实记述家庭发展状况，反对牵强附会地攀附门第，要以祖上勤勉好学的品行来教育族中子侄，“使人各知所自始，则天下可为一家。”他还常常著文，表彰乡里先贤的业绩，使之成为乡民学习的楷模.例如他在《避迹录·小引》，中记述了同乡隐士沈耕岩宁可隐姓埋名藏在深山”“年，清贫自守，也不户魏忠贤一伙妥协的事迹，他的儿子沈元佩冒着兵火瘴气，万里寻父，从西南边睡将老父迎回故乡。文章写得十分感人。由于梅文鼎重视教化，以身作则，所以，在他任族长期间，“梅氏无公庭狱讼几三十年，族属数千人，无敢博戏者，或侮其父兄，僻宗祠扑击之甚痛。君段，赴吊哭失声。”
梅文鼎日常生活非常简朴.粗茶淡饭，从不奢侈。但乡里公益之事，无论大小，他均带头筹划，便利乡民。村里修桥，他带头捐款，号召乡民凡家有田在河西者，都要出钱出力.80岁时，他主持重修了梅氏宗祠.原来的梅氏祠堂是300多年前质齐公修建的，靠近宛溪。天长日久，溪水改道，冲刷墙基.祠堂破损严重，族中想修，苦于财力不足，久未动工。于是，梅文鼎亲自规划，捐资筹款，用了6年时光将祠堂修缮一新。祠内设置不奢侈，另加盖了20多间书屋讲堂，名为文峰家塾，供子孙学习之用。梅文鼎常去家塾督促勉励后辈刻苦攻读，就象当年祖父对他一样。
康熙六十年(公元1721年)秋，这位一代科学宗师与世长辞。在他生命的最后几个月，康熙皇帝让他的孙子梅压成回乡省亲，侍奉汤药。
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