王怀隐等人“搜隐微，求妙删繁，探赜要，诠括简编”，撰成《太平圣惠方》一书，书中强调医生治疗疾病必须辨明阴阳、虚实、寒热、表里，务使方随证设，药随方施，并论述了病因病机、证候与方剂药物的关系。王氏等采用按脏腑和各科病证分类的体例，先论后方，在每门之下先引《诸病源候论》的理论为总论，然后汇集方药，体现了理、法、方、药较完整的辨证论治体系，具有较高的临床实用价值。
王氏等重视脏腑疾病，把“脏腑疾病”置于所载各种疾病之首，对脏腑的生理病理、虚实寒热、主证诸方，均作了论述。计有13种肝胆病方，14种心与小肠疾患，18种脾与胃疾患，14种肺与大肠疾患，16种肾与膀胱疾患。如肝脏病，即记有治肝虚补肝诸方，治肝实泻肝诸方，治肝气不足诸方，治肝脏中风诸方，治肝风筋拘挛诸方，治肝壅热头目不利诸方，治肝气逆面青多怒诸方，治肝脏风毒流注脚膝筋脉疼痛诸方和治肝风冷转筋诸方等，然后又根据每一类型中所出现的不同症状，施以不同的治法，有纲有目，条分缕晰。对五脏用药，王氏并加以明确归类，其中肝脏用药有蕤仁等28种，心脏用药有麦门冬等23种，脾脏用药有黄芪等25种，肺脏用药有款冬花等26种，肾脏用药有肉苁蓉等21种，这种归类方法，对后世医家有很大影响。王氏等还总结出95种病的通用药，并选用了一些前代罕用或不用的药物。故宋人蔡襄曾说《圣惠方》多“异域瑰奇”之品。
王氏于经络、腧穴以及刺灸、治法等方面，亦“采摭前经，研复至理”，有所发挥提高。他们还非常重视医德和医术的修养，并设专篇阐述。在《太平圣惠方卷第一叙为医》中指出：“夫为医者，先谙甲乙素问，明堂针经，俞穴流注，本草药对，三部九候，五脏六腑，表里虚实，阴阳盛衰.诸家方论，并须精熟，然后涉猎诗书，该博释老，全之四教，备以五常，明希夷恬淡之门，达喜舍慈悲之旨，…一是以学者必须傍探典笈，邈审妍媸，服勤以求，探赜无厌。忽恣道听，自持己长，炫耀声称，泛滥名誉，……夫如是则须洞明物理，晓达人情，悟造化之变通，定吉凶之机要，视表知里，诊候处方，常怀拯物之心;并救含灵之苦，苟用药有准，则厥疾必瘳。若能留心于斯，具而学之，则为医之道，尽善尽美，触事皆通矣。”其对医术修养之要求，至今仍有重要的现实意义。
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