三令五申，就是指多次命令和告诫，希望引起重视并绝对服从。三令五申原本是古代的军事用语，是指军队将领指挥军队作战，士兵必须绝对服从的作战原则。后来泛指上级对下级的命令，或长辈对晚辈的告诫，态度严肃端正，语气严厉，带有很强的强制性色彩。
这个典故与孙武有关，出自《史记·孙子吴起列传》。孙武是春秋末期的军事家，被后世人尊称为“兵圣”。本是齐国人，后来到了吴国，将所写的兵法十三篇，也就是被后人统称为《孙子兵法》的书籍，进呈给吴王阖闾，受到重用。《孙子兵法》共计五千多字，十三篇，为后世的军事家所学习和应用，目前还被翻译成英、日、德、法、俄、捷、朝等文译本，被国际公认为“世界古代第一部兵书”，除了被应用于军事领域，甚至还跨界应用到经济、体育等领域。
当初吴王阖闾看了十三篇兵法后，很是喜爱，可是这些都是纸上的理论，不知道在实践中有没有作用。于是就问孙武，“先生，文章我都已经看过了，可以拿军队试一试吗?”孙武说当然可以。吴王又问：“那么，可以用女人试一试吗?”孙武说行。
孙子武者，齐人也。以兵法见于吴王阖庐。阖庐曰：“子之十三篇，吾尽观之矣，可以小试勒兵乎?”对曰：“可。”阖庐曰：“可试以妇人乎?”曰：“可。”于是许之，出宫中美女，得百八十人。(引文出自《史记·孙子吴起列传》)
吴王就召集宫中的女子出来，共计一百八十人，带到校场上供孙武驱使练兵。孙武把这些人分为两支队伍，每队九十人，让吴王最宠爱的两名宫姬当队长，都拿着长戟。孙武问道：“你们知道胸口和左右手以及背后吗?”众宫女都说知道。孙武就说：“向前就看我胸口，向右就是你们的右手方向，向左就是你们的左手方向，向后转就是转到你们背后的方向。”
宫女都齐声回答：“知道了。”规矩既然讲好了，孙武就令人搬出铁钺，也就是古代杀人的刑具，当即三令五申，不听从命令者，斩之。然后击鼓挥舞令旗，让宫女们向右转，可是宫女们觉得好玩之极，嘻嘻哈哈地打闹着，根本就不听从号令，导致队形大乱。
孙武大声说道：“纪律没有讲清楚，号令得不到执行，这是将领的责任。”于是再一次三令五申，全部都得听从将领的号令，号令一出必须严格执行，不执行军令者，罪当诛。讲完纪律条令后，孙武击鼓挥舞令旗，让队伍向左转。这些宫女们依然嘻嘻哈哈地打闹不休，根本就没有把纪律当一回事。
孙武严肃地说道：“既然纪律已经讲明，号令也明白无误，但是没有按照指令行事，那就是队长和士兵们的责任了。刚才已经讲过了，没有执行军令者，当斩。”于是喝令左右，将两名队长拉出去，用铁钺斩首示众。
孙子曰：“约束不明，申令不熟，将之罪也;既已明而不如法者，吏士之罪也。”乃欲斩左古队长。(引文出自《史记·孙子吴起列传》)
吴王在看台上慌了神，急忙派人对孙武说：“寡人已经知道将军善于用兵，这两名爱姬要是不在了，寡人会食不甘味，夜不能寐，千万不要杀了。”孙武说：“臣受王命为将，将在军中，可以不接受君王的命令。”于是杀了两名队长。孙武重新任命了两名队长，继续击鼓号令，宫女们都严格地按照将令执行，再也没人敢出声嬉笑了。
孙子曰：“臣既已受命为将，将在军，君命有所不受。”遂斩队长二人以徇。用其次为队长，于是复鼓之。妇人左右前后跪起皆中规矩绳墨，无敢出声。(引文出自《史记·孙子吴起列传》)
三令和五申，在古代的军令上，原本有具体的指向，那么，它们具体所指都是什么呢?在《武经总要》里有所解释。所谓“三令”，一令观敌之谋，视道路之便，知生死之地;二令听金鼓，视旌旗，以齐其耳目;三令举斧，以宣其刑赏。所谓“五申”：一申赏罚，以一其心;二申视分合，以一其途;三申画战阵旌旗;四申夜战听火鼓;五申听令不恭，视之以斧。“三令”与“五申”的原意是教育将士应该在点阵中或军事行动中明确作战守则。
《武经总要》是北宋宋仁宗年间官修的一部军事著作，由曾公亮和丁度两人主持编写，分为军事理论和军事技术两大部分，学术价值非常高。
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