孙瑒的祖父孙文惠，曾任南齐的越骑校尉、清远太守;父孙循道，在梁朝时任中散大夫，以德操淡泊而闻名。孙瑒少时卓异不凡，喜用谋虑智略，博览经史典籍，尤其擅长作文书。孙瑒早年在梁朝时担任轻车将军、临川嗣王的行参军，经屡次升迁后任安西将军、邵陵王萧纶属下的水曹中兵参军事。萧纶出镇郢州时，孙瑒携全家相随，深受其赏识与恩遇。
崭露头角
太清二年(548年)，侯景之乱爆发，孙瑒获授假节、宣猛将军、军主。王僧辩讨伐侯景时，王琳作为前军，王琳与孙瑒为同学，他便表荐孙瑒任戎昭将军、宜都太守。孙瑒又随王僧辩前往武昌援救徐文盛，适逢侯景部将宋子仙攻陷郢州，孙瑒等便留军镇守巴陵，修治战守之备。四月，侯景军抵达巴陵，日夜攻围，孙瑒率所部全力拒战，叛军败退。其后，孙瑒随王僧辩讨伐军顺流而下，及至克复姑熟时，孙瑒力战有功，被任命为员外散骑常侍，封爵富阳县侯，食邑一千户。不久后，授职假节、雄信将军、衡阳内史，未及赴任，又晋升为衡州平南府司马。因击破黄洞蛮贼有功，获授东莞太守，兼广州刺史。旋即任智武将军，督管湘州事务。
承圣三年(554年)，广州刺史、曲江侯萧勃迁居始兴，继任广州刺史的王琳派孙瑒先行占据番禺。
承圣四年(555年)，孙瑒听闻西魏已攻陷江陵，便弃广州而投靠王琳。同年，梁敬帝萧方智被陈霸先拥立，授孙瑒为持节、仁威将军、巴州刺史。
留守郢府
太平二年(557年)，陈霸先废萧方智，自立为帝，建立陈朝。天启元年(558年)，王琳在郢州拥立永嘉王萧庄为帝，在北齐支持下起兵对抗陈朝，征辟孙瑒为太府卿(一作少府卿)，加职通直散骑常侍。
天启二年(559年)六月，陈霸先去世，其侄陈蒨(陈文帝)即位。王琳闻讯后，便任命孙瑒使持节、散骑常侍、都督郢荆巴武湘五州诸军事、安西将军、郢州刺史，总揽留守事宜，自己则拥奉萧庄出兵屯驻濡须口。
死守孤城
天启三年(560年)二月，北周听说王琳东下进兵的消息，派荆州刺史史宁率军四万乘虚袭击郢州。孙瑒的属下助防张世贵以外城投降史宁，使孙瑒失去军民男女三千余口。北周军又建起土山高梯，日夜攻逼，趁风纵火，烧毁内城南面五十多座城楼。当时郢州城中兵员不满千人，孙瑒绕城固守，亲自巡视慰问将士，依次斟酒送食，将士都乐于用命。北周军苦攻不能下，于是假意授孙瑒为柱国、郢州刺史，封万户郡公。孙瑒表面上答允，来延缓北周攻势，却在暗中修造战具、城楼、城堞及各种器械，一日之间完成严密的设防，北周军惊骇万分。
举州降陈
就在孙瑒固守郢州之时，陈朝将领侯瑱大败王琳，乘胜而进。北周军闻讯后，便解围而去。孙瑒于是拥有长江中游的全部土地，他聚集将士，并对他们说：“我与王公(王琳)协力同议，同心辅助梁室，也够得上尽心尽力了。现下时局如此，天命怎么能违抗!”于是派使者奉表向陈蒨投降。
同年，陈蒨授孙瑒为使持节、散骑常侍、安南将军、湘州刺史，封爵定襄县侯，食邑一千户。孙瑒心中不安，坚请入朝，被征召为散骑常侍、中领军。还未拜官，陈文帝陈蒨加以斡旋，对他说：“当年朱买臣愿在本郡为官，你莫非有朱买臣的意愿吗?”于是改授他为持节、安东将军、吴郡太守，并赐鼓吹一部。等到孙瑒将要赴任时，陈蒨亲自在建康周围为其饯送，他的乡人都以此为荣。
天嘉二年(561年)，孙瑒任满，被征拜为散骑常侍、中护军，赐鼓吹如故。同年，东阳太守留异叛乱，陈蒨命孙瑒督率水师进讨。
天嘉三年(562年)，留异之乱平定。天嘉四年(563年)正月，孙瑒转任镇右将军，所领散骑常侍、鼓吹如故。不久后，出任使持节、安东将军、建安太守。
光大元年(567年)，因公事被免官，不久后仍被起用为通直散骑常侍。
宣帝倚信
光大二年(568年)，陈宣帝陈顼即位。陈顼因为孙瑒的功勋名望一向显著，所以对他深加信任。
太建四年(572年)三月，孙瑒担任都督荆、信二州诸军事、安西将军、荆州刺史，出镇公安。在任内，孙瑒增修城池，怀柔边远，使其顺服，为邻国所畏惧。在职六年后，又因公事被免职，改任通直散骑常侍。
太建十年(578年)二月，吴明彻北伐失利，于吕梁兵败被俘。同年三月，陈顼授孙瑒为使持节、督缘江水陆诸军事、镇西将军，赐鼓吹一部，与淳于量等防备北周进攻 。同年十一月，任散骑常侍、都督荆郢巴武湘五州诸军事、郢州刺史，所领使持节、镇西将军及鼓吹均如故。
太建十二年(580年)，因与边境勾结之罪名而受处罚。
晚年经历
太建十四年(582年)，后主陈叔宝继位，授孙瑒为通直散骑常侍，兼起部尚书。六月，任中护军， 恢复其爵位及食邑，入朝担任度支尚书，兼步兵校尉。其后再晋升为散骑常侍，调任侍中、祠部尚书。陈叔宝频频驾临其府第，与孙瑒一同写诗作赋，来撰述美好的功勋德行，申述君臣之胸怀。之后又任五兵尚书，领右军将军、侍中之职如故。孙瑒因年老多次请求致仕，陈叔宝优诏不允。
倍极哀荣
祯明元年(587年)，孙瑒在任上逝世，享年七十二岁。陈叔宝亲临哭悼，极尽哀情，追赠护军将军、侍中如故，赐鼓吹一部、朝服一具、衣一袭，对于丧事所须由朝廷酌量加以供给，赐谥桓子。孙瑒去世后，尚书令江总为他作墓志铭，后主在墓志铭后题写四十个字，派左民尚书蔡征宣敕，镌刻在墓宅上。时人都以此为荣耀。
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