孙峻在他年少时就显现出骁勇果敢，精明强干，胆大刚决。孙权晚年时，孙峻升任武卫都尉，并任侍中。孙权临死前，孙峻受遗诏与诸葛恪、滕胤共同辅政，孙峻被封为武卫将军，都乡侯。
杀诸葛恪
孙权死后不久，诸葛恪开始专权。建兴二年春(253年)，诸葛恪不听劝谏，执意劳师动众征调大军二十万出兵攻打曹魏，这一举动使他逐渐失去民心。另一方面，诸葛恪围攻合肥新城但久攻不下，军中爆发疾病，很多将士病倒，将领报告诸葛恪，但他认为是谎报，不予理会。直到曹魏趁势进兵，诸葛恪才撤军，但吴军已伤亡惨重，上下怨声载道。诸葛恪出征归来后，将先前选曹奏准任命的各衙署长官全部罢免，重新挑选。又更换宫廷守卫，任用自己的亲信，并整理军备，准备进攻青、徐二州。孙峻见诸葛恪民心渐失，与吴主孙亮密谋后发动政变，请诸葛恪赴酒宴，诸葛恪心中生疑，便剑履上殿。之后，孙峻以如厕为由，离开一阵，孙峻回来时，大喊：”我有诏书来制裁诸葛恪!“诸葛恪大惊，一时竟拔不出剑来，诸葛恪的心腹大将张约试图砍伤孙峻，反被砍去左手右臂。诸葛恪儿子闻讯，逃跑没有来及，被孙峻所杀。后灭诸葛恪三族。
赐死孙和
建兴二年冬(253年)，孙峻诛杀诸葛恪后，升为丞相大将军，都督国内外军事，授予符节，封富春侯。同年，孙峻为巴结全公主孙鲁班，将废太子孙和迁移到新都居住，后派使者赐死孙和，孙和正妃张氏也随之自杀。
图谋伐魏
五凤元年(254年)，吴侯孙英密谋诛杀孙峻，因事情败露而自杀。次年，魏将毋丘俭、文钦反叛，与魏军交战于乐嘉，孙峻率领骠骑将军吕据、左将军留赞偷袭寿春，正好遇到文钦兵败来投，吴军就此撤回。同年，将军孙仪、张怡、林恂等想趁孙峻会见蜀汉使者时密谋诛杀孙峻，因事情败露，孙仪等自杀，受牵连被杀者数十人，其中包括朱公主孙鲁育。
惊惧而死
太平元年(256年)，孙峻受文钦怂恿伐魏，派文钦和吕据、车骑将军刘纂、镇南将军朱异、前将军唐咨率军从江都进入淮、泗一带，以便占领青州和徐州。孙峻和滕胤来到石头城为军队践行，孙峻看到吕据率领的军队部伍整齐，心生厌恶，借口心口疼痛离去。当夜做梦被诸葛恪的冤魂用剑击中，惊惧发病而死，后事托付给堂弟孙綝。
族籍除名
孙綝被吴景帝孙休诛杀后，孙峻的坟墓被刨开，殉葬的印章绶带被没收，棺椁被削薄后重新安葬。孙休又耻于与孙峻、孙綝同族，将二人族籍从族谱中削除，称之为“故峻、故綝”。
药酒起源
吴主孙亮和心腹孙峻设计谋杀大臣诸葛恪，最后得逞，中间还有一个小插曲。他们请诸葛恪赴宴，宴会中设酒，诸葛恪怀疑有毒而不饮。孙峻看出他的顾虑，就说：“将军身体不甚健康，一定有经常饮用的药酒，何不取来饮用。”诸葛恪正中下怀，于是便饮自制的药酒。酒过数巡，伏兵四起，诸葛恪还是不免一死。由此可见药酒的起源很早，这个故事值得注意的是：当时诸葛恪刚刚战败回来，并未患病，但确常饮药酒，想必这种药酒定是身体虚弱者常饮的补酒;这种酒能在宴会上饮用，必然不太难入口;这种宴会上饮自备药酒的事当时已非罕见，否则，诸葛恪怎敢在吴主的宴会上饮此种酒?因此，三国时常服药酒已较流行，这种药酒的味道偏向于酒而药味较淡，可于宴会上饮用。这是酿酒和泡制药材的方法都有了提高和发展的结果。药酒的普遍流行也可说是饮食疗法和药物学的一种成就。
宫廷政变
孙权晚年逐渐昏聩，但由于魏、蜀持续近十年的战争，江东暂处局外，又加之有长江天险和陆逊等将帅主军，孙权得以偏安。于是，他活着的时候，这些矛盾虽然暴露，但不至于酿成灭国之祸，孙权自己却是非常明白的，他说过：“我的子孙不和睦，大臣也争权夺利，以后将会有如袁家内斗之败，让天下所耻笑!(子弟不睦，臣下分部，将有袁氏之败，为天下笑!)”孙权死后，内乱一起，国无宁日。孙峻在孙权死前力保诸葛恪上台，等到诸葛恪危害到他利益的时候，他又支持孙亮把诸葛恪杀掉。孙峻死后，他弟弟孙綝开始专权，孙亮亲政以后，受不了孙綝，要除掉他，事泄，孙亮被废。随后，孙休接位，不久，孙休又联合大将丁奉等把孙綝诛杀。
辈分之乱
孙峻是孙坚的弟弟孙静(孙权的叔叔)的曾孙，孙峻曾“奸乱宫人，与公主鲁班私通”。这位鲁班公主是孙权的长女，乳名大虎，是个极厉害的女人，她与孙峻私通，害死自己的妹妹小虎。从辈分上排，她比孙峻高一辈，应该是孙峻的堂姑妈。
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