努尔哈赤是大清的奠基者，他统一了女真部落，为清军入关提供了雄厚的力量，但是有关他的汉族姓氏以及他真正的死因，却是两个很大的谜团，至今未有确切答案。
努尔哈赤，建州女真首领，后在祖地起兵统一女真各部，势力渐大后，建立后金汗国。皇太极建国封帝后，尊称其为清太祖。众所周知，清朝的皇姓为爱新觉罗。就算在许多电视剧中，皇帝微服私访，化姓不是为黄(通皇帝的皇)，就是艾(通爱新觉罗)。而在明朝的史料中，万历二十四年，努尔哈赤在一份书信中写道：“女直(真)国建州卫管束夷人之主佟努尔哈赤”，他自己说自己姓佟。就算是取个汉姓，也应该是黄或者是艾，怎么都不该和“佟”姓沾边。那么这位清太祖爱新觉罗努尔哈赤姓“佟”，又是怎么回事呢?
依据现有史料，有两种说法。第一种是说，努尔哈赤年轻的时候，有一次在山里迷了路，遇见一位汉族商人佟老翁。佟老翁不但收留了贫困交加的努尔哈赤，还将自己的女儿许配给他。从此，努尔哈赤成了佟家的入赘女婿，并改姓佟。努尔哈赤在与明朝交往的时期没有避讳这一点，直称自己为佟努尔哈赤，就是因为他的汉姓本来就为“佟”。不过清史上的记载倒不是如此，虽然努尔哈赤确实娶了一个佟姓的妻子，但是是这样记载的。《玉牒》中记载为：庚辰年元妃佟佳氏塔本巴宴之女……生子褚英，代善。有一女，下嫁何和礼。
第二种说法是，努尔哈赤的祖宗在与明朝的交往中，取汉姓用的就是“佟”，所以努尔哈赤在与明朝的交往中就沿用了祖先的汉姓。《清太宗实录》记载努尔哈赤的六世祖是猛哥帖木儿。猛哥帖木儿在元末为女真斡朵里万户府万户，也是斡朵里部首领。明朝永乐年间受抚，成为建州左卫都督。猛哥帖木儿及其后代，在与明朝的交往中一直称自己姓佟(或童)。努尔哈赤称自己是猛哥帖木儿的后代，也应该姓佟(或童)，即应该是佟努尔哈赤。
清太祖一生有许多疑惑之处，待人解答。不仅仅是他的姓氏问题，还有他是怎么死的。对于他的死因，最有说服力的就是两种说法。其一，努尔哈赤在行军途中，突然身患毒疽，因为病情蔓延的很快，不久就不治身亡了。其二，是与袁崇焕作战时，被明军的大炮击中，然后死去的。
第一种说法，大多见于清朝史籍中。对于这位清太祖之死，众多史籍无一例外皆是说他身患重病，最后不治身亡。努尔哈赤在与袁崇焕战斗的宁远之战中，败给了袁崇焕，心里郁郁不愤。又因为常年征战，年迈体衰，鞍马劳顿，积劳成疾。那年7月，努尔哈赤身患毒疽，前往清河汤泉疗养。8月病情突然加重。与前来迎接的大妃阿巴亥相见后，行至离沈阳40里的地方死去。
第二种说法，就大多是明史和其他国家的历史资料上的记载了。明人张岱的《石匮书后集·袁崇焕列传》中记载，红衣大炮打死敌人不计其数，还击中了“黄龙幕”，伤一“裨王”。敌军认为出师不利，用皮革裹着尸体，一路号哭着撤退了。一些学者分析，这个“黄龙幕”和“裨王”很有可能就是努尔哈赤。再加上金兵哭号，若只是一小首领，也不至于全军气势下降，立即撤退。
至于为什么清朝记载的死亡时间和明朝记载的死亡时间不一样，很有可能是为了军心不散。这是古代皇帝和大将常用的手段，若是龙头死亡，会对全军有很大的影响。因此努尔哈赤的儿子和部下们，决定对努尔哈赤的死秘而不发，只对外称得了重病，力保军心不散。
至于其他死因还有很多，一说努尔哈赤中了明军大炮后，在那个时候没有抗生素，最后因为感染病菌，最后病死了。还有说是被袁崇焕气死的，说努尔哈赤兵败后，袁崇焕曾派使者给努尔哈赤送信。信中所写，大意就是你一个征战四方的老将，最后却败于我这个小子之手，尽显嘲讽之意。努尔哈赤看后，极为愤怒，最后郁郁而亡。不管努尔哈赤是怎么死的，总之他还没有灭掉明朝，完成自己的大愿，就在自己68岁的时候死了。想来他死的时候，怎么也会有那么一点不甘心吧!
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