成化十三年二月，汪直心腹锦衣卫百户韦瑛称杨荣之曾孙杨业家赀巨万，常杀人，将招纳亡命下海。汪直发兵籍没福建都指挥杨业，词语牵连连兵部主事杨仕伟、中书舍人董璵，俱下狱濒死。韦瑛并籍其家。三月，左都御史李宾奏拟妄报妖言者连坐处斩，而当时西厂旗校即以捕妖言图官赏，从而大量百姓被捕冤死。同年四月，汪直令韦瑛逮捕通政使司左通政方贤、太医院判蒋宗武下西厂狱;当时礼部郎中乐章、行人张廷网出使安南归还，刑部郎中武清从广西勘事归还，浙江布政使刘福起复至京师，均被汪直并令韦瑛逮捕。御史黄本在云南、贵州清军刷归还，汪直令韦瑛搜得一个象笏，被逮捕送锦衣卫，被被贬为民。
同年五月，因为当时汪直开西厂，罗织数起大狱，百姓害怕，大学士商辂上疏称请革去西厂，罢汪直并诛韦瑛;并与宪宗发生争执，宪宗最後批准此疏，罢免西厂。并谪韦瑛戍宣府。西厂的废除并没有直接导致汪直势力的衰弱，很快汪直恢复御马监职位。同年六月，御史戴缙、王亿等人因多年无法升迁，於是依附汪直，进言称汪直为官“直釐奸剔弊，允合公论”、“汪直所行，不独可为今日法，且可为万世法”，并请求恢复西厂。宪宗大喜，并恢复西厂。
此事前後，左都御史王越因西征而与韦瑛相识，此後交往甚深，之後依附汪直。王越屡次想取代项忠的兵部尚书之职。恰逢当时项忠率领九卿弹劾汪直，两人在朝堂上亦辞色甚厉。此後汪直命东厂官校，发江西都指挥刘江、指挥黄宾等事诬陷诋毁项忠。此时给事中郭镗、御史冯瓘因依附汪直而交相弹劾项忠。项忠在朝廷上慷慨激辩而仍然下狱，竟连坐削籍。兵部武选郎中、姚璧(尚书姚夔之子)亦因联系九卿而弹劾汪直，亦被降职调。不久，大学士商辂、尚书薛远、董方，左都御史李宾一同致仕;而依附汪直的王越担任兵部尚书兼左都御史掌都督院事。十一月，汪直党羽御史冯瓘为大理寺丞，戴缙为尚宝司少卿，后擢升佥都御史;王亿为湖广按察副使。成化十四年五月，汪直请奏请武举设科，乡、会、殿试如进士例。
成化十四年(1478年)，海西兀者都指挥散出哈上书，言开原验放管指挥索其珍珠豹皮。宪宗命辽东守臣勘查，管指挥者惧。恰逢当时散出哈侄产察入贡而指挥贿赂的事情，后经调查证明是诬陷。此後又散出产察发怒，谋聚众入犯边界。守臣於是翻译番书，招散出哈来广宁当面对峙，此後发生争执，散出哈纠结部队入边，战事一触即发。汪直听闻心腹王英之言，以为镇抚辽东可以立功，於是请求前往。宪宗欲批准，而司礼监怀恩认为汪直年少喜功，於是去南阁，召集兵部尚书余子俊、兵部侍郎马文升商议。随後举荐马文升、詹升前往。汪直欲令王英与其一同前往，马文升婉言拒绝了，因此招致汪直愤恨。
马文升赴任巡抚后，命贡使重阳归谕其众，告诉明朝廷旨意。然而当时海西纵容部队进犯，马文升於是击败后再加以安抚。事情传到朝廷中，汪直称：“既然说安抚怎麼又来进犯边界?”於是向朝廷请求亲自前往。辽东各部听闻汪直擅政，不肯去接受器安抚。汪直行至开源，马文升在抚顺，汪直亦不与其联系会合。於是马文升招抚的兀者、野人、堵里吉三百馀人皆怒欲归。参将周俊恐怕此事白，於是对汪直称必须请马文升见面。此後马文升抵达后，汪直问解决方略，马文升称：“太监既至，此属即太监招出者也，何间彼此。”汪直知道此事不易解决，於是听闻马文升建议，一同抵达辽阳，再将事情汇报宪宗。
成化十五年(1479年)，陈钺担任辽东巡抚，因不瞭解当地事务，而被马文升调换，并约束其举动。汪直抵达辽东后，陈钺身著戎服伏道左边，为其扫路装饰厨房，并使得其住宿舒适。唯独马文升仍与汪直分庭抗礼，对并其随从颐指，随从遂诋毁马文升。陈钺借此再次诬陷马文升因禁农器，不与交易，而招致外部入寇。同年六月，宪宗命汪直同刑部尚书林聪即讯辽东事，马文升被逮捕下锦衣狱，谪戍重庆。
同年十月，辽东巡抚陈钺请求讨伐海西，宪宗命以抚宁侯朱永为总兵，陈钺提督军务，汪直监军。汪直抵达辽东后，有头目郎秀等四十人入贡，在广宁遇到汪直，汪直诬陷其为窥伺於是掩杀，并以捷报上报。论功，加汪直岁禄，监督十二团营;朱永进保国公，陈钺为户部尚书。至此，海西诸部以复仇为辞，深入云阳、青河堡等，杀掠男妇，皆支解屍体以报仇。边将敛兵不出，陈钺亦隐匿不上报此事。而此时，依附汪直的太仆少卿王宗彝(大学士王文之子)为佥都御史、担任辽东巡抚。
成化十六年(1480年)正月，给事中孙博上疏弹劾东厂、西厂中伤大臣;却遭到宪宗指责。同年三月，宪宗命汪直、保国公朱永、尚书王越率兵出塞，在威宁交战，并获胜，王越封威宁伯。同年四月，辽东巡按御史强珍上疏，弹劾此前太监汪直、总兵侯谦、巡抚陈钺失机隐匿的事情。都给事中吴原、御史许进等上奏，并将陈钺比喻为宋朝的黄潜善、贾似道。宪宗下诏罚陈钺俸禄，陈钺因而怨恨王越掌都督院事而纵容强珍。汪直正在巡边还京中，陈钺在郊外五十里相迎，诉强珍承奉王越旨意弹劾他。汪直大怒，王越亦来迓，汪直不见王越。巡抚辽东王宗彝遂阿汪直旨意，诬陷强珍妄奏，逮捕强珍至京，下锦衣卫狱，戌辽东。
同年七月，汪直上议征讨安南，要求调取明成祖朱棣当年征讨安南的兵马数量与图册。当时刘大夏在兵部职方司任职，故意藏匿安南的典册，并向兵部尚书余子俊陈述出兵安南利害，并极力劝阻，此事最终不了了之。成化十七年(1481年)八月，亦思马因入寇大同，宪宗以威宁伯王越佩征西前将军印镇守，汪直任监军。同年十月，巡抚宣府都御史秦紘密疏汪直纵旗校扰民，宪宗竟释放汪直。
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