猪湾事件
1961年，由美国中央情报局暗中支持的一支古巴流亡者的准军事组织袭击了古巴的猪湾。古巴军队粉碎了入侵，迅速结束了战斗。
1972年，尼克松总统连任竞选班底中的前美国中央情报局官员与闯入民主党全国委员会总部事件有所牵连。
家族珠宝
在水门事件之后，美国中央情报局局长James Schlesinger发誓要找出美国中央情报局历史中是否还有其他危险的秘密，致使调查牵扯出很多秘云。
但是，在编辑报告时，Schlesinger升职改任国防部长，美国中央情报局的新领导William Colby接手了这份名为“家族珠宝”的693页文件。报告中提到，美国中央情报局曾策划要杀害菲德尔 卡斯特罗和其他外国领导人、监视美国人、窃听他们的电话线并阅读其纳税申报单、在不知情的人类受试者身上进行LSD试验。Colby最终移交了这份报告。
伊朗叛军事件
里根政府的部分官员违反禁运规定，帮助向伊朗出售武器。收入用于向尼加拉瓜一个右翼的叛军游击队组织提供资金。1986年，里根总统承认防御武器已经转移到伊朗。
解读苏联局势
中情局一名前资深情报分析家弗里兹W·埃马斯表示，一些绝密情报看上去显得美国当年对苏联的了解透彻。他指着一份题为《苏军未来战争思考》的绝密档案说：“中情局当年的专家对苏军未来30年的作战模式与意图都进行了有模有样的分析。然而，我们现在才知道，这些报告与分析完全是在公开资料的基础上发挥出来的。他们完全是靠记者或者学者提供的资料，比如说苏联领导人开会的时候进入会场的秩序，《真理报》上苏联领导人的排名，以及苏军公开报道的大演习等。”，“西方基本上是靠收听苏联的电台广播、阅读苏联的新闻报纸来分析苏联的局势的。”一份中情局1953年有关斯大林之死的情报是这样写的：“我们无法确定斯大林是否已经死了一段时间了，也不知道他是否死于谋杀，或者他就是如公开的报告所说的那样死去的。”
热衷内讧
传奇特工霍华德·汉特与国外行动屡屡受挫形成鲜明对比的是，中情局在美国国内行动起来浑身是劲。比如说1972年6月中情局特工霍华德·汉特向局里申请说：“急需一名精于撬门开锁的好手，最好是已经退役的特工。”这份申请很快得到批复，行动的结果就是导致尼克松下台的“水门事件”。
除此之外，中情局特工还于20世纪60～70年代对美国国内的反战组织展开渗透，以期发现它们是否“获得外国的资助”。比如说一份1972年的绝密档案声称，披头士首席歌手列农“出钱资助反战组织”，试图破坏该年度美国共和党和民主党全国大会。
9·11事件
9·11事件使美国中央情报局成为舆论谈资。一段时间以来，中情局在美国国内频频受到攻击，导致局长辞职。因此，美国总统布什重申设立国土安全部的重要性。
棱镜门
棱镜计划(英文名称：Prism)是一项由美国国家安全局自2007年起开始实施的计划。该计划的正式名称为“US-984XN”。
根据报道，泄露的文件中描述PRISM计划能够对即时通信和既存资料进行深度的监听。许可的监听对象包括任何在美国以外地区使用参与计划公司服务的客户，或是任何与国外人士通信的美国公民。国家安全局在PRISM计划中可以获得的数据电子邮件、视频和语音交谈、影片、照片、VoIP交谈内容、档案传输、登入通知，以及社交网络细节。综合情报文件《总统每日简报》中在2012年内在1,477个计划使用了来自PRISM计划的资料。
关于PRISM的报道是在美国政府持续秘密地要求威讯向国家安全局提供所有客户每日电话记录的消息曝光后不久出现的。泄露这些绝密文件的是国家安全局合约外判商的员工爱德华·斯诺登，并在2013年6月6日，在英国卫报和美国华盛顿邮报公开。
PRISM的前身是小布什任内在九一一事件后的恐怖分子监听计划(Terrorist Surveillance Program)。在当时这个计划曾遭到广泛批评，且其合法性因未经过外国情报监视法庭(Foreign Intelligence Surveillance Court)批准而受到质疑，但之后的PRISM则得到了该法庭的授权令。在奥巴马任内，国家安全局持续运作PRISM。
PRISM计划在2013年6月3日首次被《华盛顿邮报》和《卫报》对外揭露;两家媒体取得了与PRISM有关的秘密文档。 根据这些文档，数家科技公司参与了PRISM 计划，包括(按加入项目的时间)微软(2007年)、雅虎(2008年)、Google(2009年)、Facebook(2009年)、Paltalk(2009年)、YouTube(2010年)、Skype(2011年)、美国在线(2011年)以及苹果公司(2012年)。此外，Dropbox也被指控“即将加入”这项计划。
在泄露的秘密文档内的一页幻灯片中，显示了两种数据来源：“上行” (另一个监听项目的代号) 和PRISM。 “上行”项目在承载互联网骨干通信内容的光缆上安装分光镜, 复制其通信内容;PRISM则是从上述美国服务提供商的服务器直接进行收集。
PRISM让情报机构能对实时通信和存储在服务器上的信息进行深入监视。任何使用上述服务商的美国境外客户及与国外人士通信的美国公民都是该计划允许的监听对象。国家安全局经由PRISM获得的数据包括电子邮件、视频和语音交谈、视频、照片、VoIP通话、文件传输、和社交网络上的详细资讯。其中98%的PRISM结果是基于来自雅虎、Google和微软提供的数据。2012年间的《总统每日简报》内共引用了1,477项来自PRISM的数据。
PRISM的年度花费约为2000万美元。
英国的政府通信总部【GCHQ，与美国国家安全局对应的信号情报(SIGINT)机构】最早从2010年6月起就能访问PRISM系统，并在2012年使用该计划的数据撰写了197份报告。PRISM让GCHQ 得以绕过正式法律手续来取得所需的个人资料。
监控议员
美国官员2014年3月5日称，关于美国中央情报局(CIA)监控对他们进行调查的参议院情报委员会成员的报道，中情局正在进行调查其雇员是否有违规行为。美国参议院情报委员会主席范因斯坦称，中情局的检察长正在就参议院情报委员会侦查CIA滥用关押和审讯程序时发生的事件进行调查。熟悉此调查的匿名官员称，对中情局的指控包括其雇员是否对参议院的调查人员进行了不当监控，并可能暗中访问了他们正在使用的电脑。 此前，美国媒体报道称，在国会对中情局进行调查时，中情局允许参议院调查人员在其总部的一个安全房间内，使用电脑访问上百万份绝密文件，对布什时代中情局对折磨和拷问的使用进行调查。而中情局监控了这些电脑，违反了与参议院情报委员会的协议。
中情局拒绝对此作出评论。而美国司法部既不承认，也不否认中情局检察长曾向司法部提到过这些指控。 美国《纽约时报》2014年8月1日报道说，美国中央情报局局长约翰·布伦南承认该机构曾监控美国国会参议院相关雇员的电脑，并对此表示道歉。
刑讯报告
2014年12月9日美国会参议院发布报告，首次披露了美国中央情报局(CIA)在小布什政府时期对恐怖嫌犯暴力刑讯的情况。
美参议院的这份报告名为“CIA拘押与审讯报告”，里面详细记录了自“9·11”事件以后，CIA如何利用“水刑”、关禁闭、剥夺睡眠等残忍手段从恐怖嫌犯口中获取情报。整个报告耗时5年时间，耗资4000多万美元。参议院9日公开的只是报告中一份近500页的概要，而全长6000多页的报告全文尚未全部解密。美参议院在报告中指出，CIA的刑讯手段比此前披露的更为“残暴”，CIA官员此前有意向时任总统小布什以及国会隐瞒真相，导致暴力刑讯持续发生。报告还认为，CIA的暴力刑讯并未达到预期效果，没有获得重要情报。报告显示，“9·11”事件发生后，美国以反恐为名逮捕了至少119名恐怖嫌犯，并将其关押在位于美国境外的多处秘密监狱中。在审讯过程中，CIA探员曾对多名嫌犯施以“水刑”，迫使嫌犯连续180个小时不睡觉，还曾威胁袭击嫌犯家人。多名嫌犯在刑讯过程中丧生，多人落下终身残疾。负责发布这份报告的参议院情报委员会主席范斯坦2014年12月9日表示，通过刑讯得到的“情报”被证实根本不存在，或价值不大。一些恐怖嫌犯为躲避刑罚不得不编造“情报”。她承认，CIA在一些审讯中所用的手段已经到达“虐待”的程度。
美国总统奥巴马当天表示，CIA的残酷刑讯手段有违美国的价值观，也不符合美国的反恐政策和国家安全利益。他还表示，CIA的做法严重损害美国形象，不利于美国与盟友发展关系。在奥巴马执政初期，他曾下令停止CIA在海外的刑讯逼供行为，并同意对这一行为展开调查。在参议院完成有关调查后，他表态支持公开调查报告。在这份报告公布后，多名共和党议员刻意淡化该报告的可信度，称公开报告是民主党导演的一场报复行动。小布什及多名前CIA官员也纷纷表态，极力为自己辩护。小布什在报告发布前曾对媒体表示，“无论这份报告说了些什么，那些CIA探员都是爱国者，诋毁他们的贡献是大错特错。”[9]
维基解密
2014年12月21日，“维基解密”网站发布两份美国中情局(CIA)机密文件。这两份文件为在国外执行任务的特工“出谋划策”，教他们如何持假身份证件顺利入境。[10]
多国情报泄露
2015年2月23日，总部设在卡塔尔的半岛电视台突然曝光数百份南非等国情报机构的绝密档案。这些档案涉及到南非与一些国家的幕后交易，及各国在重大国际事件背后频繁的间谍行动。被泄露档案的时间跨度从2006年一直到2014年12月。其中包括南非情报机构与美国中情局之间的秘密往来信函。美国中情局曾多次在巴以问题上指手画脚，对南非的情报机构提出一些要求。[11]
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