侯安都出生于一个富裕的家族，在年轻时展现出博学多才的才华，不仅精通武艺，还被乡里视为雄豪之人。后来，始兴内史萧子范征辟他为主簿。随后，他跟随陈武帝平定了侯景之乱，参与袭击王僧辩，多次击退北齐军队，为陈武帝建立了陈朝做出了贡献。他被任命为镇西将军、南豫州刺史，并封为西江县公。
陈武帝去世后，侯安都支持陈文帝登基，并平定了王琳的叛乱。他被提升为司空，并晋升为清远郡公，后来改封为桂阳郡公，并因平定留异之功被加封为侍中、征北大将军。
自从平定了王琳之后，侯安都自视功劳卓著，大肆招募文武之士，组织骑射训练，评判诗文，并邀请褚玠、马枢、阴铿、萧摩诃、裴子烈等人为宾客，家中聚集了成千上万的人。他的部下将领也大多不守法度，遇到问题就寻求侯安都的庇护。陈文帝对此非常不满，但侯安都却没有悔改的意思，反而越发傲慢。
后来，侯安都陪陈文帝举行宴会，问道：“现在相比起我当初作临川王时如何?”陈文帝没有回答，但侯安都一再追问。无奈之下，陈文帝只能回答道：“这虽然是天命，但多亏了侯公的帮助。”宴会结束后，侯安都还向皇帝借用供帐水饰，打算在殿堂上与妻妾聚会。尽管陈文帝答应了他的请求，但内心并不高兴。第二天，侯安都在宫中摆设盛大宴会，自己坐在皇帝的位置上。
早些时候，重云殿失火，侯安都擅自带着将士闯入殿内，这让陈文帝非常不满，并对他产生了警惕之心。后来，当周迪发动叛乱时，陈文帝不顾朝中大臣的建议，派遣吴明彻前去讨伐叛军，并多次派使者前往侯安都的部下进行巡视和调查。侯安都得知此事后心中不安，于是派遣别驾周弘实去找舍人蔡景历打听宫中的消息。蔡景历将这件事奏告给陈文帝，指称侯安都谋反。
563年(天嘉四年)，陈文帝任命侯安都为征南大将军、江州刺史，并将他召回建康。同年六月，在嘉德殿上宴请侯安都时，陈文帝在席间将他逮捕，并囚禁在西省，同时将他的部下召集到尚书朝堂，没收了他们的兵器后释放，公布了蔡景历的奏疏，公开宣布侯安都的罪状。次日，侯安都被处决，时年四十四岁。不久之后，陈文帝下诏，命令厚葬侯安都，并宽恕他的家属。
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