《醒来》中，沈克希最终为摧毁日军的“沉睡计划”献出生命。她曾与军统特工郑佳勋联手，击毙细菌战核心人物星野博士，并在送出关键情报后，遭日军刺刀杀害。
故事的另一条线上，苏门走进公用电话亭，拨通电话，告知对方：财神已死，启动新人，拿到密码本。圣诞前夕，星野的实验取得进展，他将成果交由手下送往南京，并决定在圣诞夜让全体人员外出聚餐，唯独沈克希和良子留下——沈克希要整理数据，良子则想休息。入夜后，沈克希密切留意良子的动向，发现她悄然溜进星野的办公室。沈克希推断对方是军统的人，为掩护她，便主动走到门口与守卫攀谈。不料星野突然乘车折返，沈克希急忙退回，用琴声向良子示警，良子闻声加紧拍照。
星野招呼沈克希进房间吃蛋糕，沈克希为他调了一杯花茶。星野让她弹琴，自己凑近动手动脚，而沈克希注意到藏在钢琴后的良子。就在这时，星野忽然倒地昏厥——他对花粉过敏。沈克希立即大喊来人，星野被紧急抬走救治。趁乱，沈克希取走实验用的小白鼠，塞进垃圾桶，因为苏门曾告诉她，收垃圾的是自己人。良子持刀逼问沈克希身份，沈克希表明目标一致，并指出星野的数据已加密，必须将密码本送出去，而自己有安全渠道。良子选择相信她，把东西交给她，沈克希随即将其放入垃圾桶。
星野恢复后匆匆赶回办公室，命人将沈克希和良子分别带来。良子知道沈克希藏了东西，故意打碎桌上的暖水瓶制造动静，引开守卫。两人最终被带到星野面前，星野质问谁是内奸，偷走了密码本和实验小白鼠。两人均否认，星野便致电影佐求助，杜黄桥随即带着陈开来进入研究基地。得知是来辨认内奸，陈开来内心紧张不已。杜黄桥一眼认出沈克希，直接向星野揭穿她的共党身份，同时点明良子是军统的人。
为逼她们开口，星野将硫酸摁在沈克希手背上，她疼得大叫，手背瞬间灼烧腐烂。杜黄桥用枪抵住两人，威逼说出实情。两人心照不宣，开始相互揭发，实则彼此掩护传递信息。沈克希用手指轻叩莫尔斯电码——陈开来在战场上曾学过——告知他东西藏匿的位置。良子也看似在揭露沈克希，实则将信息表达得更明确：她声称沈克希曾告诉自己东西藏在宿舍。杜黄桥立刻命人去搜，陈开来趁机离开。良子瞅准时机，抓起注射器刺向星野，沈克希也抄起硫酸瓶砸去。杜黄桥慌忙开枪，两人双双倒在枪下。星野被硫酸严重灼伤，最终不治身亡。陈开来匆匆赶到垃圾桶旁翻找，迅速将东西装入怀中，趁乱撤离。
