慈安太后还不到44岁，正值盛年，却突然毫无征兆就去世了。那么，她究竟是怎么死的呢?
关于慈禧太后的死，目前有两种说法：一是被慈禧太后害死，二是得了脑心血管突发疾病死亡。
认为慈安太后是被慈禧太后害死的，主要有三个理由：
一是慈禧感到了危机。之前慈禧和慈安相处得很好，是因为慈安不揽权，同时，毕竟是慈禧的儿子当皇帝。很多事情，都是慈禧在做主。因此慈安虽然是正宫，但对慈禧并不构成太大的威胁。但后来同治皇帝去世，光绪皇帝上台后，慈禧没有了同治这种儿子的依靠。随着光绪越来越大，慈禧的权力空间将越来越小。另一方面，在慈安去世的前一年，慈禧生了一年的重病，因此事情就交由慈安去做了。虽然后来慈禧病好了，但是慈安并没有要把权力再交回给慈禧的意思，因此，慈禧感到了危机。
二是慈禧没有了顾虑。慈禧之前一直顾虑慈安，据《崇陵传信录》这样的史料记载，是因为咸丰去世前，害怕权力欲望很强的慈禧干政，专门下了一个密诏给慈安。让慈安在关键时候，把密诏拿出来，镇住慈禧。但是，后来由于慈禧不断地讨好慈安，甚至采用介子推对晋文公的方式，终于感动了慈安。慈安为了表示和慈禧的亲密无间，把那个密诏拿出来烧掉了。正是由于慈安烧掉了密诏，她也就没有什么可以钳制慈禧的。慈禧害死慈安，也就有恃无恐了。
三是慈禧厌倦了共权。从辛酉政变开始到慈安去世的二十年时间里，一直都是慈安和慈禧共同执政。而且在大是大非上，主要还是慈安做主。比如开办“洋务运动”，就是慈安支持奕干起来的。比如同治选皇后，最后同治选择慈安太后喜欢的阿鲁特氏。随着年纪变大，慈禧并不喜欢这种两宫共同做主的模式，她想要独自做主。尤其是要在光绪皇帝亲政之前，实现独立做主的目的。等光绪皇帝亲政后，如果光绪和慈安太后联合起来，就没有慈禧什么事了。正是因为有这样的想法，因此，慈禧才害死了慈安。
但是，以上这些说法，大都只是记载也野史中，或者出自学者们的可能性分析，正史中并没有相关记载。而且，就算慈安真是慈禧害死的，那么，慈禧采用什么方式害死慈安，谁是帮凶，都完全没法确定。所以，慈禧害死慈安的说法，并不可靠。
认为慈安是得了脑心血管突发急病而死的，也有以下三个理由。
一是《翁同龢日记》曾记载，慈安太后在同治二年及同治八年得过两场病。根据翁同龢对慈安太后病情的描述，慈安太后所得的这两场病，很有可能就是脑心血管疾病。也就是说，这个脑心血管疾病是慈安太后的老毛病，慈安太后又发病，可能性是很大的。
二是同样根据《翁同龢日记》对慈安最后得病的病情描绘，以及慈安太后用药的情况，她也非常符合脑溢血等急症的症状。慈禧可以对慈安太后用毒，但是并不能让她得脑心血管疾病。
三是慈安太后去世后，根据《翁同龢日记》以及《德宗实录》的记载，慈禧并没有任何隐瞒，整个安葬过程也非常透明，同时也让王公和大臣们瞻仰了慈安太后的遗容。如果慈安是被毒死，或者是其它非正常死亡，那么，慈安的遗容肯定是不能给所有人看的。既然慈禧把慈安的遗容给大家看，就说明不存在慈禧害死慈安的问题。
当然了，之所以大家总是怀疑慈安是慈禧害死的，既有慈禧独裁专权及做事狠毒的本性，让人们不得不怀疑;同时，也是因为慈安太后去世后，清政府走上慈禧独裁时代的同时，也走上最终灭国的命运，让后人诸多的感慨唏嘘。
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