法塔赫的最高权力机构是代表大会，大会闭会期间由革命委员会行使最高权力。革命委员会，由“法塔赫”代表大会(一般500人)选举产生，负责选举产生中央委员会。中央委员会是法塔赫的最高领导机构，下设主管军事的“暴风”部队总司令部以及财务、外交、组织和宣传等部门。从1980年5月法塔赫第4次代表大会以来，亚西尔·阿拉法特一直担任中央委员会主席兼“暴风”部队总司令。阿拉法特去世后，法鲁克·卡杜米继任中央委员会主席。
法塔赫的代表大会应该每5年召开一次，但“五大”于1989年8月召开后，由于内外局势动荡，新一届会议屡次推迟。
2009年8月4日，为期3天的巴勒斯坦民族解放运动(法塔赫)第六次代表大会4日在约旦河西岸城市伯利恒开幕，这是法塔赫在时隔20年后首次召开代表大会，也是首次在巴勒斯坦本土举行的代表大会，引起了舆论和媒体的高度重视。
此次代表大会的主要内容为选举法塔赫新领导人、修订法塔赫行动纲领和调整对以色列的政策等。大会将从2200多名代表中选出120名法塔赫革命委员会新成员，再从中选出21名中央委员会成员及其领导人，以实现现任领导层的“更新换代”，为法塔赫的领导机构补充新鲜血液。不过，由于控制加沙地带的巴伊斯兰抵抗运动(哈马斯)禁止400名法塔赫代表离开加沙，因此实际参会代表只有1800人左右。
与会代表们还将对一份有关调整对以色列政策的文件草案进行讨论。该草案旨在实现对以斗争形式的多样化，如对扩建的犹太人定居点实施温和抗议、在隔离墙地带进行集会等。不过，该草案中还是保留了对以色列使用武力的权力，而且还预设了在巴以和谈陷入僵局或破裂的情况下，法塔赫单独在约旦河西岸和加沙地带宣布巴勒斯坦为独立国家的可能性。
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