以前是被人管，现在是管别人。被人管时不自在，不免心怀怒气，现在管人了，而且权力至高无上，就能由自己的性吗?朱元璋发现，古来那一套管人的方法还是挺不错的，还得用，不过，在这方面他也有一些发明创造。
要丞相还是不要丞相
明朝建立之初，各级官僚机构还沿用元朝的制度。早在朱元璋做吴王的时候，他就着手在自己的辖区建立行政机构，设立了行中书省，以李善长为右相国，徐达为左相国。这时百官礼仪以右为上。到了吴元年(1367年)，改为以左为上，李善长改为左相国，徐达改为右相国。到了洪武元年，在中央，设立中书省，中书省长官就改为左、右丞相了(正一品)。李善长、汪广洋、胡惟庸，先后担任过左、右丞相。丞相之下设有平章政事(从一品)、左右丞(正二品)、参知政事(从二品)。
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中书省内的办事机构：
左、右司，
有郎中(正五品)、
员外郎(正六品)、
都事、检校(正七品)、
照磨、管勾(从七品)。
参议府，
有参议(正三品)、
参军、断事官(从三品)、
断事、经历(正七品)、
知事(正八品)。
都镇抚司，
有都镇抚(正五品)。
考功所，
有考功郎(正七品)。
中书省统领百官，总理吏户礼兵刑工六部的事务，中书左丞相极为崇高，权力极大，所谓“一人之下，万人之上”。洪武初，徐达常在军旅，中书省由丞相李善长掌握权力。洪武四年，李善长罢相，又以汪广洋为丞相，洪武六年汪广洋罢相，又任命胡惟庸为丞相。
但是胡惟庸专权骄横，终于引起朱元璋不满，洪武十三年，朱元璋兴胡惟庸之狱，胡惟庸被处死，不再设立丞相，连中书省也废除了。从此，皇帝以外再也不可能出现另一个权力中心，皇帝以外再也不可能出现一个与他争夺权力的人。
丞相被废后，由皇帝直接统率六部，可说大权独揽。但是，皇帝精力有限，必须借助于办事机构处理政务，于是就设立了春、夏、秋、冬四辅官，后来四辅官被废除，翰林院、左右春坊的官员成了皇帝身边的办事员。
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元朝在地方上设行中书省，朱元璋攻下集庆(今南京)后，曾经自领江南行中书省。以后每攻占一地，就设立行中书省。行中书省的官员，自平章政事以下与中书省相同。后来，各地废除了行省，改设承宣布政使司，掌管一省行政。
在中央，都察院负责监察，地方设提刑按察使司掌管监察司法。元朝的行省权力很大，是中书省的派出机构。明朝的布政使司，权力就小多了。
天下兵马谁掌握
朱元璋以武功起家，控制军队对他来说十分重要。元朝中央的军事机构是枢密院，朱元璋占领集庆(今南京)后就建立了行枢密院，后又设立了诸翼统军元帅府。不久，枢密院被废，改设大都督府，其长官为大都督，朱元璋任命侄子朱文正为大都督。大都督府地位很重要，有权节制京师和各地的军事。大都督之下设有司马、参军、经历、都事等官。
到吴元年(1367年)后，大都督府不再设大都督，而设左右都督(正一品)为长官，以下设同知都督(从一品)、副都督(正二品)、佥都督(从二品)，其下设有参议(正四品)、经历、断事官(从五品)、都事(正七品)、照磨(从七品)等官。
洪武十三年(1380年)，明朝发生了一件大事，丞相胡惟庸因为谋反被处死，中书省被撤销，不再设丞相，与此同时大都督府也发生了重大变化，改为中军、左军、右军、前军、后军五个都督府，每府设左右都督(正一品)、都督同知(从一品)、佥都督(正二品)，其下设有经历司，有经历(从五品)、都事(从七品)等官。
五军都督府分别统领京师和全国各地的卫所军队。但是锦衣卫和其他皇帝的亲军不归五军都督府管。
明朝的军队有京军和地方的卫所军。京军又分卫所军和负有特殊任务的锦衣卫等保卫皇帝的亲军。洪武四年(1371年)京军达二十万七千八百人。明朝的军队以卫所为编制，所谓“一郡者设所，连郡者设卫”。大概五千六百人为卫，一千二百人为千户所，一百二十人为百户所。
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在各省设有都指挥使司，与地方布政使司、按察司并称为“三司”。洪武年间，全国共有十七个都司、三百二十九个卫，还有一个留守司六十五个守御千户所。
明朝的卫所士兵都是世袭的，军户世世代代当兵。每个士兵除承担军事任务外，都有一份土地，征战守卫之余耕种土地，是军饷的来源之一。所以，朱元璋曾经夸口说：“我京师养兵百万，要不费百姓一粒米。”
明朝的军事制度错综复杂，每当有征讨，要由皇帝任命总兵官，调各卫所军归其指挥。打完仗以后，将领交还印信，军队又回到各个卫所。
在中央政府机构的六部中还有一个兵部。兵部是干什么的呢?兵部设尚书(正二品)、左右侍郎(正三品)等官。兵部的职责是“掌天下武卫官军选授简练之政令”，也就是说，负责选拔、任命全国都司卫所的军官，军队的训练，包括各地军队的部署、军队装备的管理等等。
如此复杂的军事系统，形成了相互制约、相互监督的机制，以保证全部军事大权牢牢掌握在皇帝手中。
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