董晋在唐玄宗后期中明经科，唐肃宗即位后，被任命为秘书省校书郎，供职翰林。之后，还任过汾州司马、淮南节度使崔圆的判官，及主客员外郎等职。
唐代宗大历年间(766—779年)，董晋曾随同李涵护送崇徽公主嫁回纥，因不辱使命，回朝后拜司勋郎中，后迁转秘书少监、左金吾将军等职。
唐德宗即位后，董晋先在朝廷太府卿、御史中丞，后外任华州刺史。这时，四镇之乱爆发，前往平乱的泾原镇兵路经长安时发生哗变，德宗逃往奉天(今陕西乾县)。泾原变兵在长安拥立朱泚为主。朱泚派兵攻华州，董晋弃城赴奉天跟从德宗，被封为国子祭酒。不久，董晋出使抚慰恒州，回经河中时，节度使李怀光也起兵反叛朝廷，并与朱泚相呼应。董晋在河中对李怀光晓以君臣大义，劝他不要助朱泚为乱。李怀光听从董晋的劝说，虽不满于朝廷，但终不与朱泚相勾结，这对当时的政局产生了积极的影响。
奉天之难平定后，德宗返回京师，董晋迁任左金吾卫大将军、尚书左丞，当时韩滉执政，威权显赫，韩滉仗势陷害右丞元琇，虽朝臣都认为元琇冤枉，但慑于韩滉权势敢怒而不敢言。董晋挺身为元琇极力辩解，颇为朝臣历称道。
贞元五年(789年)三月，董晋为门下侍郎、同中书门下平章事(即宰相)。因另一宰相窦参正得宠于德宗，大权独揽，董晋但奉职而已。窦参专政，引起了德宗的猜忌。唐德宗向董晋询问窦参的过失，董晋如实作了回答，德宗于是罢免了窦参。董晋心感到惶恐，上疏辞职。
贞元九年(793年)，董晋被起用为礼部尚书兼兵部尚书、东都留守、东都畿汝州都防御使。
不久，宣武(今河南开封)节度使李万荣死，德宗授董晋为尚书左仆射、同中书门下平章事，兼宣武节度副大使。本来李万荣临死前已让同乡亲信邓惟恭接任，这样，邓惟恭对董晋的来任非常不满，以至发展到谋图反叛。董晋得知后捕杀其党羽，囚送邓惟恭到京师，德宗对邓惟恭将功折罪流放汀州，但又怕董晋柔弱不能制御宣武的骄兵悍将，调汝州刺史陆长源为其司马管理军务。陆长源执法严刻，多追究镇兵的往日恶行。董晋开始支持他，后来见这样不利于与镇兵的关系，就制止他的作为。董晋又用孟叔度管理财赋，而孟叔度为人轻佻，不尊重镇兵，为镇兵所反感，虽然如此，因董晋谦虚谨填，俭约循旧，使镇兵还大体安定。
贞元十五年(799年)二月三日(3月13日)，董晋在宣武军去世，终年七十六岁。德宗为他辍朝三日，追赠太傅，谥号“恭惠”。董晋死后不到十日，宣武即发生兵乱，乱军虐杀陆长源及孟叔度。
主要成就
纵观董晋一生，其才能表现是多方面的：他出使回纥不辱使命;在韩滉权盛时，挺身而出为元琇辨解;在四镇之乱时游说李怀光不叛朝廷;在宣武时，平息邓惟恭之乱，井抚御其骄兵悍将。
逸闻趣事
唐德宗时，董晋和窦参一同为相。所有的大事都由窦参决定，董晋唯唯服从。窦参逐渐自满傲慢，德宗不满意他。窦参嘱咐董晋，要他向皇帝奏请给事中窦申做吏部侍郎。德宗严肃地说：“这是不是窦参的主意?董晋不敢隐讳，以实话相告。德宗就问窦参的过失，董晋一一回禀。不久，窦参便被贬官。董晋也数次上表请辞，德宗于是将其罢相，改授兵部尚书、东都留守等职。适逢宣武军节度使李万荣病重，他的儿子作乱。朝廷就任命董晋为汴州节度使。董晋受命后，仅带随从十几个人，直赴郑州。汴州(宣武军首府)方面并未派人出迎，董晋的部下和郑州官吏都很害怕，都劝他说：“汴州节度府的都虞侯邓惟恭是应该来迎接的。他不仅没有来，还乘着李万荣病重，攫取了兵权。现在节度使到了这里，他还不来迎接你，他的想法已经很明白了。恐怕咱们得暂时回避一下，以便等待时机。”董晋说：“我奉命做节度使，只能按时到任，怎么可以逗留不前?”大家都担心他有危险，唯独董晋自己恬然自处。到了离汴州几十里的地方，邓惟恭才来迎接。董晋看到邓惟恭连马都没下，记在心里。到了节度衙门，仍然让邓惟恭主持军务。邓惟恭只知道董晋是朝廷派来做节度使的，但摸不清他会怎样做。
邓惟恭本以为他自己应当接替李万荣做节度使，故意不派人接董晋，企图让他害怕，希望董晋不敢到汴州来，没有想到董晋会来得这样神速。董晋这么快地来了，临近了汴州，邓惟恭只好去迎接，但心里怀着鬼胎。董晋以邓惟恭傲慢无礼，图谋不轨的罪名，把邓惟恭发配到岭南。朝廷担心董晋柔弱，又派汝州刺史陆长源任宣武行军司马，协助他管理军务。董晋性格宽厚，待人谦和。每次行事，大多按照旧例办理，使军心逐渐安定。陆长源为人严苛，请求按照自己的意思处理。董晋总是在开始答应，待到陆长源拟好方案后，又扣下不用。董晋委任节度判官孟叔度管理钱粮，此人为人轻浮，不尊重士卒，遭到众人记恨。董晋逝世后十日，汴州大乱，乱军杀死了陆长源和孟叔度，并且把他们的肉煮成粥来吃。
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