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大和国建立之后，随即开始扩大自己的统治，不断侵占周边部族的土地，加上侵略朝鲜，引发了一系列的问题。
实际上，日本这一时期的权力斗争从宫廷外延续到了宫廷内，在皇室力图巩固自己统治的同时，也是内斗不断。
据日本史书记载，履中天皇就和同母兄弟住吉仲皇子争夺皇位，安康天皇也是在讨伐木梨轻太子之后才夺得了大统。安康天皇还听信皇子预谋夺权的谗言，杀死了大草香皇子，自己又被大草香皇子的儿子眉轮王杀死。
在当时，宫廷政变司空见惯，不过一直没有出现另外的家族取代皇族的现象。
伴随着皇室内部的争斗，各豪强和新旧势力的斗争也日益加剧。
原先掌握实权的大伴氏由于提出将在朝鲜的殖民地任那归还给百济的想法而遭到攻击，失去其原有的政治优势，取而代之的是物部氏和苏我氏，双方之间也采取各种措施展开了一场政治上的争斗。
针对新传入的佛教，代表日本传统宗教的物部氏和支持新事物的苏我氏发生了激烈矛盾。
苏我氏和新来移民联合起来，拥护新宗教，最终掌握着财政大权的苏我氏凭借着和皇室的联姻关系和财政话语权取得了胜利。当时虽然物部氏掌握着军队，但由于受至高无上的天皇掣肘，最终在权力争斗中败下阵来。
物部氏，日本大和朝廷有权势的氏族。掌有军权，与大伴氏族一起世代担任大连(执政官)。在是否接受佛教问题上与主张接受佛教的苏我氏发生对立并开战，因战败而势力衰弱。苏我氏是日本从古坟时代到飞鸟时代代代都出大臣的有力氏族。
其中的苏我稻目、苏我马子、苏我入鹿等都在相当长时期里控制了日本的政局。
苏我氏的崛起很大程度上是依靠与皇室的错综复杂的关系链。苏我稻目在钦明天皇时期被封为大臣，公元541年，钦明天皇纳了苏我稻目的两个女儿坚盐媛和小姉君为妃子。
敏达天皇即位后死于瘟疫，而后即位的是钦明天皇与苏我氏之女所生的用明天皇、崇峻天皇和推古天皇。
苏我稻目死后，苏我马子继承父亲大臣之位，并成功地将自己的三个女儿分别嫁给了外甥崇峻天皇、甥孙圣德太子和甥孙舒明天皇为妃，故而以外戚的身份掌握政权，称霸朝野。
可以说，此时的皇权已经通过这种所谓的联姻方式“嫁接”到了苏我氏家族手中，这也是之后苏我氏家族能把与之对立的物部氏消灭，控制日本政权的一个重要的原因。
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