法国天主教势力同新教胡格诺派(即加尔文派)在1562-1598年(另一说则为1559-1594年)之间进行了一场长期战争。它虽然带有明显的宗教色彩，但就其性质和内容而言，则是法国的一场内战。这场战争使正在上升的王权面临崩溃，贵族分裂势力有所抬头。这场战争是法国历史上的一段无政府状态时期，战争的结果是天主教、胡格诺教派各有所得，有助于王权的重新振兴和加强。

　　第一次

　　(1562–1563)

　　开始于1562年3月1日吉斯公爵弗朗索瓦·德·洛林在路过瓦西镇附近时，发现新教徒违反国王的禁令在城内做新教仪式，他认为这是对他的权威的公然挑战，立即下令对犯禁的新教徒进行攻击，死伤近200人。"瓦西镇屠杀"成为持续30多年的胡格诺战争的直接导火线。

　　双方的兵力不多，在战争中都依靠外国列强，天主教派依靠西班牙;加尔文派依靠英国、德意志公爵和荷兰教友。

　　1562年12月德勒一战天主教派的将领蒙莫朗西被俘，圣安德烈元帅战死。

　　1563年2月，吉斯公爵在围攻奥尔良时被暗杀。孔代也在德勒被俘，纳瓦拉国王安托万死于鲁昂之围。

　　1563年3月，太后凯瑟琳·德·梅第奇发布安布瓦斯敕令，给予新教徒信仰自由和在指定地区举行宗教仪式的自由。

　　第二次

　　(1567–1568)

　　1567年9月，孔代和科利尼率新教军队劫持太后和查理九世未遂，包围巴黎。11月10日，在巴黎北郊圣德尼一战，双方不分胜负。德意志新教选侯派兵驰援胡格诺派，天主教徒和宫廷屈服。

　　1568年，双方签订《隆朱莫条约》，重申安布瓦斯敕令。

　　第三次

　　(1569–1570)

　　1568年9月，查理九世在天主教派的压力下撤销先前发布的宗教宽容敕令，禁止胡格诺教徒举行任何宗教仪式，一切官吏和法官都必须宣誓效忠天主教会，新教牧师必须在两个星期之内离开法国，双方的第三次战争由此爆发。

　　1568年8月:逮捕新教徒首脑孔代亲王路易一世·德·波旁和海军上将加斯帕尔·德·科利尼。1569年3月，天主教军队在雅尔纳克大败新教军队，孔代阵亡。10月3日，蒙孔图尔战役，科利尼又被击败。1570年8月，太后卡特琳签署圣日耳曼敕令，使新教徒获得礼拜自由和在几个设防安全区自派总督的权力。

　　第四次

　　(1572–1573)

　　1572年8月23-24日夜间，胡格诺派的重要人物正聚集巴黎，庆祝其领袖波旁家族的亨利的婚礼。亨利·吉斯(吉斯公爵之子)以巴黎各教堂钟声为号，率军队发动突然袭击，杀死胡格诺教徒2000多人。由于24日正值圣巴托罗缪节，因此这一血腥的夜晚在历史上被称为圣巴托洛缪大屠杀，由此对抗激化。

　　这次大屠杀之后，法国再次出现分崩离析的局面。胡格诺派首先在南部和西部组成联邦共和国，对抗中央政权。1573年6月，查理九世签署《拉罗竭尔和约》，准许新教徒在拉罗竭尔、尼姆和蒙托邦举行教仪，给予这些城市信仰自由。

　　第五次

　　(1574–1576)

　　1574年新教领袖孔代亲王亨利一世·德·波旁和纳瓦拉的亨利从宫廷的逃亡。 1574年5月，新教派再度起事。朗格多克在原总督丹维尔伯爵领导下正式分裂出去。1575年，新教派发动全面起义，胡格诺教徒全部动员起来，为圣巴托罗缪之夜的屠杀报仇雪恨。

　　1576年5月，亨利三世签署了博利厄敕令，谴责圣巴托罗缪之夜的大屠杀，同意为死难者昭雪，除巴黎和王室住地外，一切法国城市都有权举行新教仪式。敕令还给予胡格诺教徒担任公职的权利，准许他们占有在政治上、军事上居于优势的8个城市，在城市里建立混合司法机构，高等法院也设立特别法庭，以保证进行公正的辩论。博利厄敕令实际上承认了胡格诺教徒占领的地区为"国中之国"。

　　第六次

　　(1576–1577)

　　博利厄敕令引起天主教派的强烈不满。1576年，吉斯在北方组织"天主教神圣同盟"，自行征税、招募军队，要求恢复王国的宗教统一，拒绝执行敕令，两派战争又起。战争中，胡格诺派遭受重大挫折，中部的拉夏里戴和西部的布鲁日落入天主教同盟手中。1577年9月，两派缔结《贝日拉克和约》，规定解散天主教同盟，限制博利厄敕令给予新教徒的自由和权利。新教徒只能在每个区的一个城市和自己的安全区内举行宗教仪式，他们对安全区只有6年的支配权。

　　第七次

　　(?–1580)

　　1579年–1580年 : 以亨利三世解散神圣同盟开始。最后签订Fleix和约， 约定新教徒对设防安全区有6年支配权。

　　第八次

　　(1584–1593)

　　1585年开始，法国国内开始了"三亨利之战"。各方首领分别是国王亨利三世、吉斯公爵亨利、波旁家族的亨利。1585年，吉斯公爵亨利取得西班牙国王腓力二世的支持，在南特重组天主教同盟，巴黎、里昂、波尔多、马赛、第戎等城市纷纷归附。同时，法王亨利三世又撤销了两次和解的敕令。胡格诺教徒只得在波旁家族的纳瓦拉国王亨利的旗帜下应战，并得到英国和德意志新教诸侯的支持。1587年10月20日，新教军队在库特拉击败天主教同盟军。吉斯兄弟不久也重创胡格诺派军队。1588年5月，天主教同盟控制下的巴黎迎接吉斯公爵入城，包围王室住地卢浮宫，国王亨利逃出巴黎，并在鲁昂签署联盟敕令，满足了天主教派的一切要求。同年12月，国王的近卫军暗杀了第三代吉斯公爵亨利一世·德·洛林和他的兄弟第二代吉斯枢机主教路易二世·德·吉斯。巴黎闻讯后发生暴乱，并成立以第四代吉斯公爵为首的新政权。受到新旧教派夹攻的亨利三世同纳瓦拉国王结盟。1589年8月1日，亨利三世被刺身亡，暗杀者是个狂热的教士，纳瓦拉国王亨利成为法王亨利四世。但天主教派拒不承认，内战战火继续燃烧。亨利四世连续在军事上取得胜利，但无法攻入巴黎。鉴于法国90%以上的人口都信仰天主教，亨利四世于1593年7月25日在圣德尼大教堂改信天主教。巴黎的大门由此而为他打开。6天之后，新旧教两派势力达成为期3个月的休战协议。1594年3月22日，亨利四世凯旋进入巴黎，受到隆重欢迎。此后的四年中，各地纷纷归附，亨利四世还赶走了混战之中攻入法国的西班牙军队。

　　1598年，亨利四世颁布南特赦令，最终结束了这场持续了三十多年的战争。

　　战争结果

　　亨利四世通过1598年的宗教宽容的南特敕令，宣布天主教为国教，胡格诺教徒在法国全境有信仰新教的自由，在担任公职方面享有同天主教徒同等的权利。5月，西班牙同法国议和。胡格诺战争自此结束。

　　胡格诺战争的结束，使法国王权得到振兴。战争期间，巴黎和外省的高等法院经常抵制王命，各地贵族不同程度地恢复了"自由"特权，如征税和募兵。内战的结束和亨利四世的胜利，有助于重振王权，为民族国家的统一和经济的复兴创造了条件。亨利四世在首相苏利的协助下进行了全面整顿和改革，使工商业和农业迅速繁荣起来，国库由空虚变为充盈。亨利死后，路易十三的首相红衣主教黎塞留彻底铲除了贵族的独立势力，建立了以王权为核心的地方管理体系，实现了中央对地方较为严格的控制。

　　"南特敕令"虽然保留了胡格诺教派的一些特权，但仍具有划时代的意义。它是基督教欧洲国家实行宗教宽容政策的第一个范例。教皇克莱芒八世曾谴责"南特敕令极为可憎，它给予每个人以信仰自由，而这是世间最有害的事情"。这从反面表明了"南特敕令"对于解放人的思想、打破天主教一统天下的局面具有"开天辟地"的影响。

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