世称白河殿、染殿的藤原良房出生于延历二十三年(804)。因为嵯峨天皇的眷顾，良房于天长二年(825)出任藏人，其后历任中判事、大学头、春宫亮、左近卫少将等职，并在承和元年(834)刚满三十岁的时候便做到了从四位下参议的位置。依靠着父亲的政治力量及妹妹在宫内的作用，良房步步高升:承和二年正月升至从四位上，四月，任从三位权中纳言兼左兵卫督，同年任左中将;承和六年，又兼按察使;承和八年，由权中纳言升为中纳言。
藤原北家的藤原冬嗣因为得到嵯峨天皇的宠信，从藏人头一直升到左大臣的高位，并且将其女顺子嫁与正良亲王(即后来的仁明天皇)为妃;作为回应，嵯峨天皇也将自己的女儿洁姬嫁给藤原冬嗣的次子藤原良房。
仁明天皇所立的皇太子是淳和上皇之子恒贞亲王;但良房一心想让自己的妹妹顺子所生的道康亲王成为皇太子。察觉到这种状况，不愿卷入政治权力斗争的旋涡的恒贞亲王多次向天皇表明了辞太子之位的心意，却被天皇和上皇力劝而未能如愿。承和九年七月十日，皇太子恒贞亲王的亲信春宫坊带刀舍人伴健峰拜访了平城天皇的皇子阿保亲王，并透露出"嵯峨上皇病情日深，眼见国家变乱将起，将奉太子之命事先往东国早作打算"的意图，阿保亲王随即将谈话内容封书进呈嵯峨上皇的皇后橘嘉智子。橘嘉智子立即召见中纳言藤原良房，并将阿保亲王的密呈传奏于仁明天皇。七月十七日，伴健峰及恒贞亲王的另一位心腹但马权守橘逸势被近卫府拘禁;恒贞亲王惊于事泄，再上辞表，但又被仁明天皇慰留下来。到了二十三日的时候，恒贞亲王终于被废，大纳言藤原爱发、中纳言藤原吉野、参议文室秋津以下六十余人被连坐流放。八月四日，道康亲王正式被立为太子;良房因功晋为正三位大纳言。
承和之变是藤原良房踏入政治舞台后经历的第一件大事。其时除了阿保亲王的密呈之外，并没有确切的证据能够证明恒贞亲王意图谋反，其前往东国的打算，看上去更像是为了逃避即将到来的政治风暴而作出的自保行为;但藤原良房敏锐地把握住了这个机会，显示了自己果断狠辣的政治手腕，一举排除了恒贞亲王这个前进道路上最大的障碍，甚至还不惜流放了自己的亲叔父藤原爱发和式家的叔父藤原吉野。道康亲王终于被立为太子;藤原良房也成功地取代了藤原爱发成为大纳言，为自己进入权力中枢奠定了坚实的基础。
(848)，良房升任右大臣。两年之后，道康亲王即位为文德天皇，其与良房之女明子所生的惟仁亲王被立为太子。天安元年(857)二月，良房受封为从一位太政大臣。翌年，文德天皇驾崩，年仅九岁的惟仁亲王即位，是为清和天皇。身为天皇外祖父的良房总揽政务，成为事实上的摄政。
贞观八年(866)闰三月十日的夜里，平安宫大内里的正殿入口应天门遭人纵火焚烧，其两侧的栖凤楼与翔鸾楼也一同毁于大火之中。这场人为的灾难震惊了朝廷内外。不久，大纳言伴善男便告发纵火犯乃是左大臣源信和中纳言源融。伴善男向来与源信不和睦，这次更是借机想一举除掉源信，于是跟右大臣藤原良相商量，命良房的养子左中将藤原基经包围左大臣府邸并逮捕源信。基经认为兹事体大，便将此事告知了良房。良房立即向天皇申诉源信无罪，源信才得以免罪。不料，在五个月之后的八月三日，备中权史生大宅鹰取向朝廷告发伴善男、伴中庸父子才是真正的纵火犯，引起了朝廷内外的又一场大骚动。束手无策的清和天皇在八月十九日正式任命外祖父良房为摄政--"重敕摄行天下之政者"，令其收拾事态。良房将伴善男关押起来，开始调查此事。就在这时，伴善男的家臣生江恒山和伴清绳因杀害大宅鹰取的女儿而被捕。在酷刑之下，生江恒山和伴清绳供认出火烧应天门乃是由伴善男、伴中庸父子共谋的。九月二十二日，良房将伴善男、伴中庸父子及纪丰城、纪夏井等共犯流放到伊豆，并没收了他们的土地财产，排除了最后一股政治上的异己势力。
大伴氏和纪氏都是日本自古以来的名门。当藤原氏的先祖中臣氏还只是在宫中担任祭祀占卜的小官时，大伴氏、纪氏就已经是天皇身边不可或缺的重臣了。对于藤原氏的崛起和壮大，这些没落的豪门自然是心有不甘。故此，在历朝针对藤原氏的阴谋中，都少不了他们的影子。承和之变后，伴氏对藤原良房刻意压制其他豪族的做法十分不满，与纪氏等同病相怜的豪族逐渐形成了一个反对良房的小集团。良房借这次处理火烧应天门事件的机会，彻底地将这两个旧贵族势力排除出中央政权的核心，巩固了藤原氏的统治地位。
火烧应天门事件之后良房完全独掌了朝政大权。贞观十三年，清和天皇诏赐封良房三千户，内舍人二人、左右近卫、左右兵卫各六人为随身兵仗，又带仗资人三十人，年官并准三宫，良房权势达到了顶峰。次年九月四日，良房病亡，时年六十八岁。同日，清和天皇追赠良房为正一位，谥忠仁公，封美浓国。其家将良房葬于山城国爱宕郡白河边。
人物评价
藤原良房是日本历史上第一位正式的太政大臣，他以外戚的身份开摄政之先河，通过承和之变、火烧应天门等事件，排除了大伴氏、纪氏等自古以来堪与藤原氏比肩的中央豪族，进一步巩固了藤原氏的独专地位。由此开始，藤原北家迎来了全盛的摄关时代。
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