既然马宝、胡国柱、王绪等人已死，昆明外援等于就绝望了。即便如此，郭壮图和吴世璠依旧没有任何降意，死死坚守昆明城……
清军围城半年多，还是不能破城。
由于几十万清军暴露在外，加之不服水土，陆续感染疾疫，病死的日益增多。接着，由于粮饷转运不继，清军营内已经出现粮食供应困难的情况。
在这样的情况下，守城的死守，攻城的不走，双方继续僵持着，看谁能熬到最后。
到了康熙二十年(1681年)九月，康熙帝得知昆明城久攻不下，气急败坏，又下诏旨死催。同时，他还以满洲皇族特有的阴狠，指示清军将领派遣先前投降的吴军将士先登城墙做炮灰，拿这些人的尸首为清军后续攻城部队做铺垫物。
包围昆明半年多，按理说城内粮食早就尽绝了，为什么城内军民还能死守呢?经过仔细盘查，清军将领发现，昆明城一面临昆明湖，所以清军封锁线围困不严。而且，昆明坚城所赖水运的昆明湖，南北百里，一直没有严加封锁，舟船时常往来。
当时，驻守昆明湖周遭安宁、晋宁、昆阳、呈贡四州县的清军，大都是刚刚投降清军不久的吴三桂旧部将士，他们不忍心昆明城内的亲属和老战友挨饿，所以对湖区没有严加封锁。
对此，统帅部发现后马上采取措施，杀掉一批心怀同情的吴三桂旧部将士之后，赶忙改派八旗兵驻守昆明湖沿线，从此，就切断了城内的粮食来源。
九月，汉将赵良栋平定四川叛乱后，率领大兵渡过金沙进抵昆明，与章泰、赖塔两路大军会师。
赵良栋虽然是个汉人，但为满洲贵族打起仗来比满洲人还狠。看到包围昆明的满洲将领一直害怕伤亡而按兵不动，赵良栋就兀自率领自己的宁夏绿营汉军对昆明发动猛攻。
赵良栋所部连修整都不修整，不计死伤，即刻投入战斗。
看到汉军如此凶猛，章泰都不好意思了。十月八日，他只得下令满汉各军进兵，直抵城下，把昆明城围困数重。于是，清军不分日夜，开始肉搏攻城。
数十万清军兵临城下，运输线又被截断，城中粮食早已食尽。而箭矢嗖嗖，射入城中的招降书又表示投降免死。在这种情况下，守城的吴军将领已经有不少人生出贰心，陆续有人偷跑出城，向清军投降。
从出降的吴军将领口中得知，昆明城内确实已经山穷水尽，章泰等人终于放胆攻城。
清军猛攻数日，但昆明坚城真是太牢固了，一兵当垛，百兵莫上……
康熙二十年(1681年)十月二十八日这天，昆绝望之余，明城内的吴国柱、吴世吉等人准备献城投降。他们集结手下士兵，密谋发动兵变，想生擒逮捕吴世璠和郭壮图后，开城献给清军。
忽然听到殿外呐喊声声，才得知城内守军叛变消息。至此，吴世璠彻底绝望。这个吴氏子弟，当时只是一个16岁少年，还真非常有血性。他立即穿上皇帝的服装，昂首登临大殿。坐在宝座上后，举目四望一番后，忽然举刀自刎。
大概由于少年人手力弱，一刀未死，这位美少年就自己楞生生以手抉出喉管，又硬划一刀，终于鲜血如喷……
吴世璠这个少年，风仪翩翩。当他被吴三桂政权官员从北京偷运到昆明的时候，年方8岁。此前，嫡母为大清公主，爷爷为大清王爷，他的孩提时代肯定在北京过着锦衣玉食的贵族子弟生活;而后，祖父吴三桂起兵，迢迢路远，父亲吴应熊和几个兄弟在北京遭到清廷杀戮、剪除，这个孩子在昆明之时，肯定知道这些消息。
8年多来，虽然居于深宫，吴世璠身边肯定有硕儒老师教他民族大义。耳濡目染，国仇家恨，对这个少年来说，一切都绝对不再是书本上的文字，而是血淋淋的现实。正是在这样的教化之下，吴世璠这样一个16岁的、没有经历过任何生活磨砺的少年郎，才能毅然决然挥刃自尽。比起他软弱怯懦的父亲吴应熊，简直判若云壤。其悲壮刚烈，不逊南明少年英雄夏完淳!
当然，由于“三藩起事”被清廷定性为谋逆的“三藩之乱”。吴世璠作为“逆首”之一，加上他摊上了一个自私自利的老丈人郭壮图，故而在历史中一直被丑化、妖魔化……
得知“皇帝”自杀，吴世璠的“皇后”郭氏也投环自缢。宫中从死的宫内，多达百余人.
郭壮图最后时刻的表现还算爷们，闻变之后，马上和他的儿子郭宗汾紧闭府门，然后相继自刎而死。
郭壮图和吴世璠都死了，城内叛变的吴军将领怕不好向清军交差，就抓住了吴三桂的“大学土”方光琛及其子侄等人，大开城门，出城向清军投降。
数十万军清军围城近一年，死伤无数。待到昆明城降，出于报复心理，清军清将入城后大肆杀掠一番，珍宝美女，恣其所欲!诸部清军，只有赵良栋所部约束严格，杀掠不多。
得城之后，清军马上把吴世璠首级割下，传送京师，然后把吴三桂首席谋士方光琛和他子侄押到军前凌迟处死。接着，又大张旗鼓对先前事急投降的吴军将领高启隆、巴养元、李继业等人斩首示众。其间，不少吴军悍将的家属也被清军杀绝。
当时，吴三桂已死去三年多，清廷很想找到他的尸首枭首戮尸来泄愤。不过，在清军迫近昆明时，吴世璠和他岳父郭壮图已经把吴三桂尸骨改葬他处。所以，清军在昆明附近刨了数座大坟，都没有找到吴三桂尸身。
最终，清军在昆明安福园石桥下挖出一个骨灰匣，报称是吴三桂骨灰。为了请功，清军统帅部就把这匣骨灰和吴世璠首级一并送到京师邀功……
当然，无论当时还是现在，大家非常关心吴三桂爱妾陈圆圆的下落。当初就是因为这个绝色女人，吴三桂 “冲冠一怒”，使得他自己一生的命运和吴氏家族的命运得以全然改变。
但真实历史记载中，包括清军攻入昆明后对吴氏家属的登记造册，没有任何官方文件言及陈圆圆。
民间笔记、野史记载就丰富多彩，有说她自缢的，又说她出家的，有说她隐居善终的，纷纷扰扰，陈圆圆下落，成为千古之谜……
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