朱元璋建立明朝后，在虽然灭了中原地区的一些割据势力，也赶跑了元帝国势力。但朱元璋在巩固中原的时候，蒙元残余依然盘踞在北方、西北、西南边陲地带，伺机再次翻盘。这是朱元璋很头疼的地方。
1381年，朱元璋命令傅友德带蓝玉、沐英征伐云南，不久南方各部落都基本归顺了明朝，朱元璋把沐英留下治理云南。他又把目光聚焦在北方。因为漠北蒙元的起家之地，也是蒙古势力的老巢，如果不把他们消灭，迟早会明朝带来隐患。
1387年，朱元璋命冯胜为大将，傅友德、蓝玉为左右副将军，征伐北部蒙元最强的纳哈出部落，纳哈出部落哪是明军的对手，赶紧投降向明朝称臣。于是朱元璋决定对其他蒙古部落也进行打击，于是就于1388年任命蓝玉为大将军，征伐元朝皇帝脱古思帖木儿。此时蓝玉已经成为明朝一等一的大将，朱元璋可以放手让他去为明朝效命了。也正是任命了蓝玉，一场决定性战役即将打响。
经过
1388年3月，蓝玉率领15万明军北征，明军行至庆州时，蓝玉得到了情报，元帝脱古思帖木儿正在捕鱼儿海。捕鱼儿海又叫贝尔湖，此湖位于明朝奴儿干都司哈剌孩卫境内，也就是现在呼伦贝尔市新巴尔虎右旗。贝尔湖是一个不大的湖，并不是我所说贝加尔湖，贝加尔湖则是最大的淡水湖。
蓝玉得到情报后，就率军抄近路向捕鱼儿海杀来，但当大军到了百眼井处，离捕鱼儿海还有40里，依旧没有发现元军的踪迹。蓝军以为这是假情报，他认为元军已经离开这里，于是就带兵返回，此时蓝玉手下部将王弼劝蓝玉不要回去，他说：“我们率兵深入漠北，未见敌人就回师，如何向皇帝交代?”蓝玉认为王弼说的有道理，于是就采取隐蔽措施，秘密行军继续向前进。由于明军采取了穴地做饭的方式，因此谁也不知道明军已经到达。后来明军又侦察到元军在捕鱼儿海东北80时里处，蓝玉命令王弼杀入元军大营。
王弼率军发起进攻时，正赶上风沙天气，十几米看不到人影。当明朝军队到了汗帐时，元军才有所察觉，但此时已经晚了，脱古思帖木儿根本没有预先准备，他只得带着太子天保奴、知院捏怯来、丞相失烈门等数十人向哈拉和林方向逃去，蓝玉派兵追赶没追上。北元太尉蛮子仓促迎战，战败被杀。不过这次战役，已经重创了脱古思帖木儿的势力，他的二儿子地保奴、123个嫔妃公主、3千多北元官员、7.7万人口以及15万头牲畜都被明军俘获。
结果
捕鱼儿海战役在明史上意义很大，有人认为这场战役残灭了北元残余，明朝彻底完成了全国的统一，而且还俘获了吴王朵儿只，此人是成吉思汗一母同胞弟弟哈赤温的后裔，从此蒙元势力再也对明朝不构成威胁了。
从蒙元势力看，脱古思帖木儿率领残部西逃途中，遇到了北元部将也速迭儿，而也速迭儿是阿里不哥的后裔。阿里不哥当年是铁定的大汗，他是成吉思汗四儿子拖雷最小儿子，忽必烈的亲兄弟。蒙哥死后，阿里不哥被推举为大汗，此时忽必烈听说后，然后率兵返回，在开平也继位了。于是兄弟两人便展开了战争，打了4年，阿里不哥战败，最终忽必烈把大汗之位夺到手中。也速迭儿作为阿里不哥的后裔，一直不满忽必烈一系，这次碰到脱古思帖木儿大败，正好是报仇的时候，于是也速迭儿杀死了脱古思帖木儿及太子天保奴，丞相失烈门与知院捏怯来，只得南下投降明朝。
脱古思帖木儿一死，整个北元就没了主心骨，内部内斗不断，出现了四分五裂的状态“部帅纷挈，五传至坤帖木儿，咸被弑，不复知帝号”。
据资料记载，北元政权虽然离开中原，但在漠北还有一套很完整的治理体系，但经过捕鱼儿海战役，蒙元想再次入主中原的梦想破灭了，黄金家族也失去了主导蒙古各部落的发言权。各部落各自为战，虽然有过短暂统一，但一直没有形成对明朝的威胁。
遗憾
很多人都把捕鱼儿海当成明朝一场决定性战役，的确这场战役取得了胜利，但也是借助了天气才出其不意取得。如果天气好，北元有所准备，明军能否胜利呢?
对于有人说明朝通过捕鱼儿海一战，彻底统一了中国。让我们看看明朝版图就明白了。明朝打完这一仗，为什么不派军统一整个蒙古草原呢?因此，这场战役留下很多遗憾，明朝就开始变为“内敛”王朝，不仅固步自封，还以为“高枕无忧”。这也正是明朝前期胜利来得太顺利，没把北部的蛮夷放在眼里，但危险也悄悄向明朝袭来。
元顺帝逃离中原60年后，北方的又形成了一支强大的蒙古势力，但此势力并不是蒙古黄金家族所建，而是出自非黄金家族瓦剌部。该部落居然俘虏了大明皇帝明英宗，让人疑惑的是，明朝在统一全国的过程中，从来没有俘虏过一位元朝皇帝或者蒙古部落的可汗。
不能否认明朝在统一战争中取得的巨大胜利，但如何巩固胜利，才是一个王朝皇帝应该想的问题。虽然明朝实现了“天子守国门”，但并没有彻底消除北部隐患，也没有派中原人好好经营蒙古草原，与汉朝经营西域差距很大。
明朝的确建立了奴儿干都司，但这个边境设置是否达到真正目的呢?为什么留下和林的空白?这都是一个谜团。明朝后期，奴儿干都司统治很弱化，如果明朝强化奴儿干都司的统治，努尔哈赤的势力还会崛起吗?
因此，通过一场战役的胜利，明朝并未实现全国的统一，也使这个王朝成为一个“小富即满”的王朝，最终因内向、内敛而走上灭亡之路。
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